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利用DNA条形码技术发现贵州省蚋类新记录
目的：综合利用DNA条形码序列和形态学特征鉴定蚋种。方法：利用车载式捕虫网于2014年7~9月在贵州省雷山、江口、德江、关岭和开阳5县采集蚋类标本，并进行初步的形态学鉴定；测定雌蚋DNA条形码序列，利用生命数据条形码系统（ BOLD ）及系统发育分析方法鉴定蚋种。结果：初步确定划分蚋属下蚋种的K2P距离阈值为4%，利用该阈值及生命数据条形码系统鉴定153只雌蚋为麻子绳蚋。结论：麻子绳蚋为贵州省蚋类新记录，分布于雷山、江口、德江、关岭和开阳5县。
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赤水丹霞来源抗白色念珠菌放线菌分离及进化分析
目的 分离、筛选抗白色念珠菌放线菌菌株,为开发微生物来源的抗白色念珠菌感染药物提供菌株资源.方法 采集赤水丹霞山区土壤样品,利用不同的放线菌选择培养基分离、纯化单菌落.提取分离菌株基因组DNA,以细菌16S rRNA通用引物PCR扩增16S rRNA基因,产物测序并比对分析以确定分离菌株的分类地位.小量发酵产物进行抗白色念珠菌活性测试.结果 筛选得到7株具有抗白色念珠菌活性的放线菌,其中6株为链霉菌,1株为地中海拟无枝酸菌.结论 从赤水丹霞山区分离得到多株具有抗白色念珠菌活性的放线菌,可为开发微生物来源的抗白色链珠菌药物提供菌株来源.
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湖北省黄冈地区啮齿动物携带汉坦病毒M片段基因特征分析
目的:探讨湖北省黄冈地区野生啮齿动物自然感染汉坦病毒(hantavirus)情况及病毒基因分型特征.方法:2012~2013年秋冬季在湖北省黄冈地区的野外及居民区采用夹夜法捕鼠.对捕获的动物进行分类鉴定,取其肺脏提取RNA,合成Seoul病毒(SEOV)和汉滩病毒(HTNV)特异性引物,以RT-PCR方法扩增部分M片段核苷酸序列,对PCR产物进行测序,并进行系统发育和序列同源性分析.结果:共捕获啮齿类动物95只,其中褐家鼠75只(78.94%).6份(8.00%)褐家鼠标本SEOV阳性.系统发育分析关系显示当地SEOV属于A组,与Z37株同源性为95.80%~96.30%(核苷酸),97.90%~100%(氨基酸).黄胸鼠和黑线姬鼠SEOV和HTNV均为阴性.结论:湖北省黄冈地区的优势鼠种是褐家鼠,汉坦病毒型别主要是SEOV,其系统发育关系属于A组,且与疫苗株Z37同源性高.该研究结果有助于为黄冈地区HFRS的预防提供理论依据.
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海单胞菌1株的分离和系统发育分析
目的 对从双齿围沙蚕消化道内分离出的菌株Y5进行系统鉴定.方法 通过形态学、生理学、气相色谱法、(+C)mol%、16S rRNA基因序列测定以及系统发育分析,鉴定该细菌的种属.结果 菌株Y5为革兰阴性细菌,直杆状,无芽孢,无鞭毛,大小为(0.5～1.0)μm×(1.5～3.0)μm;生长温度范围～0 ℃;具有嗜盐性,NaCl耐受范围10～130 /L;氧化酶、过氧化氢酶、精氨酸双水解试验阳性,不还原硝酸盐;可利用葡糖糖、麦芽糖且为惟一碳源;精氨酸脱羧试验阳性;细胞主要脂肪酸成分C18:1ω7c为1.0%、C16:1ω7c为25.5%、C16:0为12.9%,C10:0 3-OH为7.8%.DNA的(+C)mol%为7.5%.菌株Y5 16S rRNA基因序列与9种已确定的海单胞菌相似度为93%～97%.根据16S rRNA基因序列构建的系统发育树显示,该菌株与其他海单胞菌位于系统发育树的同一类群中.结论 该细菌属海单胞菌属,并且可能为海单胞菌属的一个新种,暂命名为沙蚕海单胞菌(M. aibuhitensis sp. nov).
