首页 > 文献资料
-
"实火"与"虚火"口腔溃疡患者的肠道微生物结构特征
目的:运用Illumina MiSeq高通量测序技术研究口腔溃疡型"实火"和"虚火"人群肠道菌群特征.方法:收集"虚火""实火"人群和健康人群粪便,利用Illumina MiSeq技术对各组粪便样本DNA测序.利用Alpha多样性指数、PCoA分析和heatmap聚类图挖掘属水平的差异肠道菌群种类.结果:与健康人群比较,"实火"和"虚火"人群的Alpha多样性降低,且PCoA图上显示在微生物属水平上存在差异.与健康人群比较,"实火"与"虚火"人群共同改变的微生物属有21种,"实火"人群差异改变的微生物属有20种,"虚火"人群差异改变的微生物属有8种.结论:"实火"与"虚火"是两种不同的"上火"类型.
-
"上火"人群的肠道微生物结构特征研究
[目的]对比研究"上火"人群与健康人群的肠道菌群种类,揭示"上火"对肠道微生物的影响.[方法]收集"上火"和健康人群的粪便,利用Illumina MiSeq高通量测序技术对粪便样本DNA测序,利用QIIME软件处理测序数据并计算Alpha多样性,利用PCoA和LEfSe分析方法挖掘两类人群的差异肠道菌群种类.[结果]本次研究共纳入"上火"和健康人群各35例.肠道菌群Alpha多样性指数结果显示,"上火"人群的肠道菌群多样性指数略微低于健康人群.与健康人群比较,"上火"人群肠道内含量显著上调的微生物属主要是放线菌门中的厌氧管状菌属、布劳特菌属、栖粪杆菌属、颤螺菌属、瘤胃球菌属、厌氧弧菌属、考拉杆菌属和粪芽孢菌属,显著下调的微生物属主要是拟杆菌门中的B拟杆菌属和普氏菌属.[结论]"上火"发生与肠道菌群改变密切相关,变化的肠道菌群在一定程度上能反映"上火"发生的能量代谢紊乱和黏膜免疫失衡.
-
基于Illumina Miseq平台分析胆囊结石及黏膜微生物群落的多样性
目的 探讨胆囊结石患者胆囊内结石及黏膜微生物群落的多样性.方法 选取2014年1-12月该院胆囊切除术的胆囊结石患者60例(病例组)和肝右前叶血管瘤患者11例(对照组)的胆囊黏膜样本行细菌培养,将培养结果为阴性的患者结石及黏膜进行Illumina Miseq测序分析.结果 71例患者纳入研究,对照组中样本均未检测出微生物群落DNA,病例组中微生物群落DNA提取率为94.2％.无论样本的类型,占优势为变形细菌门.同一类型结石患者的结石和黏膜微生物群落组成比例较为一致,而不同类型的组成差异较大.结论 应用Illumina Miseq测序分析能有效评价胆囊结石患者胆囊微生物群落的多样性.
关键词： 胆囊结石 黏膜 微生物 Illumina MiSeq测序
