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4-香豆酸:辅酸A连接酶文献资料
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珊瑚菜Gl4CL基因克隆与生物信息学分析
目的:对珊瑚菜(Glehnia littoralis)4-香豆酸:辅酸A连接酶(4-Coumarate:Coenzyme A Ligase,Gl4CL)基因编码区进行克隆及序列分析.方法:本研究在前期珊瑚菜高通量测序的基础上,利用cDNA末端快速扩增(Rapid Amplification of cDNA Ends,RACE)方法对Gl4CL基因全长cDNA序列进行克隆.对Gl4CL蛋白进行理化性质、蛋白二级结构及三维结构预测分析.利用实时荧光定量PCR方法检测Gl4CL基因在珊瑚菜的根、叶中的表达情况.结果:Gl4CL基因cDNA序列全长1 951 bp,编码544个氨基酸,其中开放阅读框1 635 bp,5'非编码区153 bp,3'非编码区163 bp.生物信息学分析表明,G14CL蛋白大小约为59.481 kDa,等电点为8.20.Gl4CL基因在珊瑚菜的根和叶均存在表达,且在根中表达量显著高于叶.结论:本研究为进一步开展Gl4CL基因功能和遗传调控研究奠定基础,通过深入探讨Gl4CL基因的表达调控与木质素、植株生长表型等关系,有望获得抗病虫害、抗逆性强的北沙参高产优质品系.
关键词： 珊瑚菜 4-香豆酸:辅酸A连接酶 基因克隆 生物信息学分析
