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  • 霍乱弧菌VPI毒力岛的tcpI-P和tcpH-A间隔区序列在不同菌株中的差异分析

    作者:赵英伟;阚飙;芮勇宇;高守一;刘延清;卢明俊

    目的TcpA是霍乱弧菌主要定居因子毒素共调菌毛的主要亚单位,基因位于VPI毒力岛上.古典生物型和El Tor生物型霍乱弧菌菌株的tcpA序列有较大差异,同时毒力岛上其他一些区域,主要包括部分基因的间隔区序列也存在差异.我们已在不同El Tor流行株与非流行株以及非O1/非O139菌株中又发现4种新的tcpA序列.笔者拟探明这4种不同类型tcpA序列的菌株中,VPI毒力岛上其他几个差异片段(tcpI-P间隔区和tcpH-A间隔区)是否与相应tcpA序列有平行的变异关系、进而分析毒力岛和菌株分化的多样性.方法在tcpI-P和tcpH-A间隔区外侧保守区中设计引物,扩增包含这两个间隔区的片段并进行测序,计算比较序列差异.结果基因tcpH与tcpA之间的间隔区序列两两间比较的一致性在63.3%至95.3%之间;基因tcpI与tcpP之间的间隔区序列两两间比较的一致性在26.7%至100%之间.这些间隔区序列并没有像tcpA序列在这些菌株中的差异那样显示出类似的变异水平,甚至一些菌株的tcpA序列有较大差异时、某些区域反而高度一致.结论在不同tcpA序列的菌株中tcpI-P间隔区和tcpH-A间隔区及tcpA这三个片段分化变异的速率不同,并不具有平行性.这些序列的多样性反映了霍乱弧菌VPI毒力岛以及菌株分化的多样性.这种分化也提示可能与这些区域具有结合一些调控因子、从而对环境信号产生不同方式或程度的应答的功能有关.

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