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Topomer Search文献资料
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R基团搜索策略用于HEA类β分泌酶抑制剂的三维定量构效关系研究与分子虚拟筛选
β分泌酶是治疗阿尔茨海默病(AD)的理想作用靶点.采用以R基团技术为核心的Topomer CoMFA研究HEA类β分泌酶抑制剂的三维定量构效关系(3DQSAR),构建了拟合与预测能力良好的3DQSAR模型,得到拟合、交叉与外部验证的复相关系数分别为r2=0.928,qloo2=0.605和r2pred=0.626.通过3D-QSAR模型搜索ZINC化合物结构片段源,得到活性贡献提高的R基团并结合公共骨架设计得到15个新颖化合物,其预测活性值均优于训练集中的活性高分子.用分子对接研究新设计化合物与β分泌酶的相互作用模式,结果表明,氢键和疏水性是影响亲和力的重要因素.研究表明,基于R基团的Topomer CoMFA与Topomer Search可以有效地筛选和设计HEA类β分泌酶抑制剂,所设计的分子为AD药物的研发提供了新的候选物.
