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  • 嘌呤环类mTOR免疫抑制剂的三维定量构效关系研究

    作者:常自超;汪斌;林治华

    目的 通过构建嘌呤环类衍生物与哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mTOR)的分子对接模型,并基于分子对接建立可预测性强的三维定量构效关系(3D-QSAR)模型,探讨此类化合物免疫抑制作用的分子机理,为设计新型嘌呤环类mTOR受体拮抗剂奠定理论基础.方法 本实验采用Surflex-dock研究44个嘌呤环类衍生物与mTOR的分子对接模式,采用比较分子力场分析法(CoMFA)和比较分子相似性指数分析法(CoMSIA)对嘌呤环类衍生物进行3D-QSAR研究,建立具有良好预测能力的模型.结果 Surflex-dock结果显示,此类分子与mTOR的ASP2195、TYR2225、VAL2240等活性功能残基具有氢键作用,嘌呤母环占据了活性口袋的连接链区形成疏水和范德华相互作用,从而发挥免疫抑制作用.CoMFA模型的q2=0.8,r2=0.976,佳主成分为5,立体场和静电场对活性的贡献为59%和41%;CoMSIA模型的q2=0.679,r2=0.965,佳主成分为6,立体场、静电场、疏水场、氢键供体场和受体场对活性的贡献分别为25.9%、9.5%、28.4%、24.7%和11.4%.结论 基于嘌呤环类衍生物所建立的3D-QSAR模型的q2均大于0.5,证明此模型具有良好的预测能力.3D-QSAR结果分析和分子对接相一致,疏水场、立体场和氢键作用对嘌呤环类分子的免疫抑制活性影响大,为设计新型靶向性嘌呤环类mTOR受体拮抗剂奠定了理论基础.

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