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DNA指纹法文献资料
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大鼠死后肠道菌群演替规律
目的 初步探索尸体肠道菌群的时序性变化用于死亡时间推断.方法 利用棉签擦拭颈椎脱臼处死大鼠肠道取样,通过提取肠道菌群DNA,选取16S rRNA V3区通用引物进行PCR,PCR产物进行变性梯度凝胶电泳,对得到的图谱进行组间菌群多样性与相似性分析,并对从变性梯度凝胶电泳切下的条带进行纯化、PCR、测序后获得各组厚壁菌门的主要菌群所占百分比.结果 处死后大鼠第1～30天的菌群多样性呈现减少趋势(P<0.05),组内相似性呈现下降趋势(P<0.05),第1天指纹图谱条带数、组内相似性系数(similarity coefficient,Cs)高于其他组(P<0.05),第5天与第25、30天组内Cs比较差异有统计学意义(P<0.05).在属水平,处死后第1、5天肠道菌群以肠球菌属(Enterococcus sp.)为主,第10、15、20天以苏云金芽孢杆菌(Bacillus thuringienssis)为主,第25、30天以粪肠球菌(Enterococcus faecalis)为主.结论 肠道菌群随大鼠处死后时间的延续,其组成、结构都出现了明显的变化,肠道菌群的演替与死亡时间相关.
