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Hsa-miR-181a在子宫内膜癌变过程中的表达及意义
目的:探讨hsa-miR-181a(miR-181a)在子宫内膜癌变过程中的表达及其意义。方法:选取甲醛固定石蜡包埋组织75例,其中正常子宫内膜13例,子宫内膜增生症18例,子宫内膜癌44例。提取总RNA ,采用实时荧光定量PCR技术检测各组子宫内膜组织中miR-181a 的表达量。结果:在甲醛固定石蜡包埋组织中可检测到miR-181a的表达。 miR-181a在子宫内膜癌组织中的表达高于子宫内膜增生症,在子宫内膜增生症组织中的表达高于正常子宫内膜,差异均有统计学意义(P<0.05);miR-181a 的表达与FIGO分期有关,差异有统计学意义(P<0.05)。结论:miR-181a 在子宫内膜癌组织中表达上调,可能起到了癌基因的作用;miR-181a在子宫内膜癌变过程中的差异表达可能与子宫内膜癌的发生、发展有关。
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基于生物信息学方法预测hsa-miR-181a在脑卒中发病中的分子调控网络
目的 运用生物信息学方法预测固有免疫信号分子hsa-miR-181a与脑卒中相关的分子调控网络.方法 运用UCSC基因组浏览器、人类miRNA疾病数据库、TF-miRNA调控数据库、miRNA靶基因预测验证数据库、Genecards数据库、长链非编码RNA (LncRNA)疾病数据库、DLANALAB-LncBase数据库、转录因子结合谱数据库,研究hsa-miR-181a的上游转录因子,下游靶基因及与其相互作用的LncRNA间的多个调控途径,绘制hsa-miR-181a的核心调控网络图.采用脂多糖(LPS)刺激慢病毒感染的BV2小胶质细胞,采用实时定量PCR检测Toll样受体4(TLR4)、肿瘤蛋白63(p63)、miR-181a和核因子κB p65(NF-κBp65)的水平变化,对hsa-miR-181a调控网络进行验证.结果 UCSC数据库中显示hsa-miR-181a有2个亚型,在多个物种中具有高度保守性.通过疾病分析及文献调研发现hsa-miR-181a与多种疾病密切相关,尤其是缺血性疾病.信息学分析显示hsa-miR-181a受转录因子p63调控的同时,又调控着下游靶基因,脑源性神经营养因子(BDNF)、TLR4等58个基因.此外,Lnc RNA CDKN2B-AS1的转录和其锌指转录因子Snml、n-MYC也可能与hsa-miR-181a存在相互作用.所有基因构成一个以hsa-miR-181a为核心的调控网络,在脑卒中的发生与发展中起着重要作用.在LPS刺激的BV2细胞中,TLR4、p63、miR-181a水平升高,而RNA慢病毒技术干扰小胶质细胞中的p63的表达后,p63表达降低,miR-181a水平也降低,下游NF-κB p65水平被抑制,表明p63是TLR4调节miR-181a表达的关键信号分子.结论 生物信息学方法预测并初步验证了hsa-miR-181a分子在脑卒中疾病中的调控网络,为深入研究提供了理论支持.
关键词: 生物信息学 固有免疫 hsa-miR-181a 脑卒中 调控网络