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儿童患者分离的甲氧西林耐药金黄色葡萄球菌的分子特征及毒力因子研究
目的 了解儿童患者分离的甲氧西林耐药金黄色葡萄球菌(MRSA)临床分离株的分子特征、毒力因子和药物敏感性.方法 收集2008年1月至12月上海市3家儿童医院98株MRSA和49株甲氧西林敏感金黄色葡萄球菌(MSSA)临床分离株,PCR法检测杀白细胞素(PVL)基因阳性菌株,多重PCR法对MRSA菌株进行葡萄球菌mec盒式染色体(SCCmec)分型,多位点基因序列类型(MLST)测定MRSA菌株的序列类型(ST),eBURST软件分析各型在菌株克隆复合体(CC)内的相关性,琼脂稀释法测定MRSA和MSSA对临床常用抗菌药物的敏感性.结果 98株MRSA临床分离株中有6株PVL基因阳性,阳性率为6.1％;49株MSSA临床分离株中有2株PVL基因阳性,阳性率为4.1％.98株MRSA临床分离株中,SCCmecⅡ型4株,占4.1％；SCCmec Ⅲ型23株,占23.5％；SCCmecⅣ型52株,占53.0％；SCCmecⅤ型15株,占15.3％;4株未能分型,占4.1％.MLST分析表明SCCmec已分型的94株中,4株SCCmecⅡ型为ST5；23株SCCmecⅢ型为ST239；52株SCCmecⅣ型中30株为ST59,ST5和ST1各8株,ST8和ST88各2株,ST22和ST910各1株；15株SCCmecⅤ型中6株为ST239,5株ST88,3株ST59,1株ST45.eBURST软件分析结果显示,ST8、ST239属于ST8 CC,ST1属于ST15 CC,ST910属于ST 30 CC,ST59、ST5、ST88、ST45、ST22、ST9、ST7均为各自CC的起源型别.SCCmecⅣ、Ⅴ型MRSA较SCCmecⅡ、Ⅲ型MRSA对多种非β内酰胺类抗菌药物更为敏感,未发现万古霉素耐药株.结论 儿童患者分离的MRSA临床分离株的PVL基因阳性率相对较低,SCCmecⅣ型、Ⅴ型可在院内传播,形成小范围内的流行,其基因表型存在多种ST分型.
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ANGIS--一种重要的生物信息服务系统
信息学和分子生物学都是21世纪热门的学科,两者结合产生了一门新兴学科--生物信息学.生物信息学反过来又大大促进了信息学和分子生物学的迅猛发展.
