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碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌的分子特征
目的 了解碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌(CRKP)耐药基因与毒力基因的分布及分子流行病学特征.方法 收集2015年上海地区两所教学医院临床分离非重复的84株CRKP,采用纸片扩散法检测其对15种抗菌药物耐药表型,黏液丝试验检测高黏液表型,聚合酶链反应(PCR)及测序分析常见的碳青霉烯类耐药基因(blaKPC-2、blaNDM、blaIMP、blaOXA、blaVIM)与毒力基因(rmpA、mrkD、entB、ybtS、magA、iutA、allS、kfu),多位点序列分型(MLST)方法进行克隆分型,eBURST软件对克隆分型结果进行种群结构分析.结果 84株CRKP除对环丙沙星及阿米卡星耐药率分别为77.4％(65株)和82.1％(69株)外,对其他抗菌药物耐药率高,均在90％以上,对亚胺培南、美罗培南、厄他培南耐药率均为100％.黏液丝试验阳性2株.PCR测序显示92.9％(78株)CRKP携带碳青霉烯类耐药基因,其中blaKPC-2的阳性率为90.5％(76株),分别检出1株blaNDM、blaIMP阳性菌株,未检出blaOXA和blaVIM.毒力基因mrkD、ybtS和entB分别为97.6％(82株)、92.9％(78株)和100％(84株),其他毒力基因阳性率较低.MLST分为8个ST型,以ST11为主,占71株(84.5％),ST15为4株,ST323为4株,2株高黏液表型克隆株均为ST11型.eBURST分析发现84株CRKP中有2个ST群.每个ST群分别包括2个ST型(ST11和ST1869,ST15和ST709).其他4个ST型都是单个ST型,本研究中71株ST11、4株ST15、4株ST323和1株ST45分别属于CC258、CC15、CC163克隆复合体.结论 CRKP对临床常用抗菌药物呈高度耐药状态,肺炎克雷伯菌多重耐药或广泛耐药主要与菌株携带blaKPC-2有关,CRKP中3种常见毒力基因mrkD、ybtS、entB阳性率高,ST11为该两所医院CRKP的主要ST型.
