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宿主肠道微生物群落多样性和演替分析技术的演变和发展
人或动物等宿主肠道内定植有大量微生物.但是,宿主肠道内微生物的多样性和演替一直被认为是人和动物营养研究中的黑箱(black box).经过科学家几个世纪的研究已证实:正常微生物群是一个新的人体生理学系统[1];肠道微生物菌群参与宿主对营养素的消化、吸收与合成[2];刺激其免疫机制[3].近年又发现:微生物群影响宿主基因表达,可进行微生物与宿主之间的"分子对话"[4],例如:一个人肥胖或者苗条的倾向可能部分是由生活在肠道中的微生物群体的组成所决定的(戈登,2005).可见,肠道微生物是未来微生态科学极其重要的研究领域.对于肠道微生物群落的分析方法主要有沿用已久的传统培养法和近年来兴起的基于基因序列的微生物分子生态学方法.
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Real-time PCR技术与传统培养法检测肠道沙门菌和志贺菌的比较
目的:Real-time PCR技术与传统培养法检测肠道致病菌的比较.方法:根据沙门菌、志贺菌的基因保守区设计特异性引物和Taqman探针,建立Real-time PCR技术,检测样本中的沙门菌、志贺菌,与传统培养法检测作对比.结果:Real-time PCR技术显示出特异性强、灵敏度高、操作简便快捷等优点.结论:Real-time PCR技术相比传统培养法更适用于肠道致病菌的检测和筛选.
关键词： Real-time PCR技术 传统培养法 沙门菌 志贺菌 -
2014年南京市参与传染病防治技能竞赛考核盲样检测结果分析
目的 通过采用实时荧光PCR法和培养法对竞赛盲样样品中食源性致病菌的分离鉴定,建立了针对多项目质控样品检测的快速准确方法.方法 2014年江苏省疾病预防控制中心组织的传染病防治技能竞赛中给出的盲样考核样品,依据提供的案例A和B传染病发病临床表现,锁定检测范围,先运用实时荧光PCR法进行致病菌初筛,再以荧光PCR结果为指导,用培养法进行进一步分离鉴定,终得到正确的检测结果.结果 项目A的检测结果为A-049和A-086检出福氏2b型志贺菌,A-093未检出致病菌.项目B检测结果为B-056检出肠出血性大肠杆菌0157∶H7,B-022和B-086未检出病原菌.结论 荧光PCR对传染病突发事件中致病菌的快速初筛具有重要意义,与培养法结合应用于多项目质控样本检测可减少传统培养方法漏检的可能性,提高检测效率和正确率.
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传统培养法和PCR法在分枝杆菌菌种鉴定中的对比研究
目的:对结核分枝杆菌复合群菌种鉴定的传统方法与PCR法进行对比研究,为临床应用提供科学依据.方法:将临床确诊结核病患者的317份痰标本做罗氏培养,分别用传统培养法和PCR法进行鉴别菌种,随机抽出一部分进行测序(金标准),用金标进一步鉴定两种结果的可靠性.结果:传统培养法敏感度、特异度、符合率分别为55.68％、58.33％、54.00％,而PCR法检测的敏感度、特异度、符合率分别为98.86％、50.00％、93.00％,明显优于传统培养法,两者检测的总符合率为53.00％,检测结果间差异有显著性(x2-918.64,P=0.00).结论:传统培养法检测分支杆菌菌种的结果不符合临床检验要求,且所需时间长,而PCR法方便、快速,可以较准确地确定分支杆菌菌种.
