如果你不会编程,又想发生信文章,或者想在自己课题中加入部分生信内容,让文章尽可能的高分,那么这篇影响因子大于5的生信文章值得学习和借鉴,因为它的产生完全是利用在线数据库!

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  结果一:肺癌患者中E2Fs的转录水平

公开数据库ONCOMINE

  Figure1直观地显示了各个基因在各种癌中的表达水平,红色代表高表达,蓝色代表低表达。这张图直接来源于公开数据库ONCOMINE

  登陆ONCOMINE,网址:https://www.oncomine.org/resource/login.html(需复制到浏览器打开)

  记得用教育邮箱注册并登陆,然后在左上角search框里面输入E2F1:

公开数据库ONCOMINE

  点击搜索按钮:

公开数据库ONCOMINE

  发现这就是figure1里的一部分!figure1就是用这个方法拼接得到的。

  结果二:肺癌患者中E2Fs的转录水平

  结果二有3个图,如下:

  Figure2 The expression of E2Fs in LC (GEPIA).

  Figure3 Correlation between E2Fs expression and tumor stage in LC patients(GEPIA).

  Figure4 The expression of E2Fs in LC (IHC).

  我们先看figure2。该图是通过GEPIA数据库(http://gepia.cancer-pku.cn/)实现的。

  在搜索框中输入E2F1

  确认后拉下来,可以发现figure2A的一部分就在图中。

  Figure2B也类似。

  该图与Figure3不一致,原因为我选用的数据库不同。再看生存曲线图

  Figure5 The prognostic value of mRNA level of E2F factors in LC patients(Kaplan-Meier plotter).

  这部分是通过Kaplan-MeierPlotter的肺癌数据(http://kmplot.com/analysis/index.php?p=service&cancer=lung)实现的。

  进入网站后,在搜索框输入“E2F1”,在Probeset options选择:“JetSet”,再点击左下方的DrawKaplan-Meier Plotter。

公开数据库ONCOMINE

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  文章的图基本来源于在线数据库的使用,只要你会用数据库,就能重复出来。至于发高分生信文章,那就需要专业的指导了!