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文本挖掘探索参麦注射液的临床应用特点研究
目的 探索参麦注射液临床应用规律.方法 应用文献检索方法检索(1980年1月-2012年5月)中国生物医学文献数据库收集参麦注射液文献数据,采用基于关键词频数统计的数据分层算法,挖掘数据集中证型、疾病、症状、中成药、西药等方面.挖掘结果通过一维频次及构建网络图进行展示.结果 共有3 159篇文献,结果显示参麦注射液多与虚、瘀证型因素相关;心力衰竭、心律失常、心肌炎、心肌梗死、休克是其治疗的核心疾病;主要治疗心绞痛、乏力、胸闷胸痛等症状;常与丹参注射液、复方丹参注射液、黄芪注射液等中成药合用;常与硝酸甘油、果糖、卡托普利等西药合用.结论 参麦注射液治疗的证型、疾病挖掘结果与其说明书中一致,潜在治疗证型为瘀证,潜在治疗疾病为心力衰竭、心律失常、心肌梗死等.其常与丹参注射液、复方丹参注射液、黄芪注射液等中成药合用和硝酸甘油、果糖、卡托普利等西药合用.
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利用文本挖掘技术分析中成药和西药治疗脑梗死的基本用药规律
目的 利用文本挖掘技术总结中成药和西药及其联合用药治疗脑梗死的基本用药规律. 方法 收集中国生物医学文献数据库(CBM)中治疗脑梗死的相关文献,建立Access数据库,运用结构化查询语言对数据进行处理,并运用数据分层算法分析中成药和西药及其联合用药治疗脑梗死的基本用药规律.结果 共检索出相关文献50 286篇,其中治疗脑梗死所用西药频数高的是尿激酶(1241),其次是低分子肝素(980)、依达拉奉(867)；所用中成药频数高的是丹参注射液(1063),其次是川芎嗪(431)、葛根素(294)；西药和中成药联合应用频数高的是奥扎格雷联合丹参注射液(84),其次是阿司匹林联合丹参注射液(57)、依达拉奉联合丹参注射液(55).结论 利用文本挖掘的方法,可从文献报告频数方面分析中成药、西药及其联合应用治疗脑梗死的用药规律,并为研究疾病用药规律提供方法.
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基于文本挖掘的中医药治疗类风湿关节炎骨破坏用药规律
目的 总结中医药治疗类风湿关节炎骨破坏的常用药物及药物配伍规律.方法 检索中国生物医学文献数据库及中国期刊全文数据库中应用中药复方治疗类风湿关节炎骨破坏的相关文献,运用基于敏感关键词频数统计的数据分层算法,对纳入文献中所有药物进行一维频次和二维关系分析,并将高频用药进行可视化处理,提取核心药物配伍组合.结果 共纳入81篇文献,包括46首复方、129味中药.单味药物使用频次高者为黄芪(16次,34.78％),其次为白芍、甘草(15次,32.61％);配伍组合频次高者为白芍-甘草(9次,19.57％),其次为当归-甘草(7次,15.22％)、黄芪-当归(6次,13.04％)等.将药物进行可视化呈现后显示权重高的药物为甘草,其次为独活、白芍、黄芪、骨碎补、丹参、当归.结论 治疗类风湿关节炎骨破坏的有效中药复方以益气养血药为主,以补肾、活血、祛风湿为辅,体现祛邪与扶正标本兼治的治疗思路.
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中医药治疗流行性感冒文本挖掘结果与诊疗方案的比较分析
目的 对中医药治疗流行性感冒(简称流感)文本挖掘结果及诊疗方案进行比较分析,为流感防控方案的制定提供文献学支持. 方法 对中国生物医学文献数据库中收集的流感相关文献进行文本挖掘,得到流感的常见中医证候和方药,并与中华人民共和国卫生部颁布的7个不同版本流感诊疗方案中的中医证候和方药使用情况进行对比,分析其异同.结果 流感常见中医证候为风热犯卫、湿热证、少阳病;常用方剂为银翘散、麻杏石甘汤与黄连解毒汤;常用中药依次为:板蓝根、金银花、黄连、黄芩、连翘,且金银花常与连翘、黄芩、板蓝根联用.在流感诊疗方案中,出现频率较高的中医证候为风热犯卫、热毒袭肺、气营两燔;常用方剂为麻杏石甘汤、银翘散;常用中药依次为:生石膏、炙甘草/生甘草、炙麻黄、杏仁、黄芩.结论 流感证候以风热犯卫的流感轻症多见,治疗方药以银翘散与麻杏石甘汤为主,文本挖掘与诊疗方案中证候与方药基本一致,但文本挖掘结果以流感轻症为主,诊疗方案则兼顾流感重症.
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基于文本挖掘的流行病学致病因素的提取
目的 基于文本挖掘技术,设计出能够自动提取流行病学致病因素的系统.方法 该自动信息提取系统由一个文本挖掘引擎子系统和一个基于规则的信息提取子系统构成.首先使用文本挖掘引擎标记出所有的名词短语,并收集该名词短语的语义等信息.然后利用基于规则的文本分类器,标记出流行病学致病因素.结果 为评估本系统,将由流行病学专家人工注解的文本输入该系统,评估发现好的结果F-measure为64.6％,其精确率和召回率分别为61.0％和68.8％,该结果优于其它相关研究,且其中有些错误仍可避免.结论 基于文本挖掘的方法对从流行病学研究文献中自动提取致病因素信息有很大帮助.
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蛋白质相互作用的文本挖掘研究进展
生物体的生理功能主要由细胞中的蛋白质调控,因此研究蛋白质间的相互作用成为理解生命活动的基础.使用文本挖掘方法研究蛋白质相互作用可以充分利用现有的大量文献揭示出与蛋白质相关的潜在知识,构造蛋白质相互作用网络.着重从相关的语料集和工具、所涉及的技术和方法等方面,对蛋白质相互作用的文本挖掘进行综述,并对研究前景进行展望.
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生存资料的二次研究系列之四：预后相关系统评价/Meta分析的文献计量学研究
预后指标在医学研究及临床实践中都具有重要意义。预后相关的系统评价/Meta分析对预后方面的研究资料进行评价、汇总以形成能用于指导临床实践的高质量证据。为了探索预后相关系统评价/Meta分析当前在全球范围的研究现状，本文通过检索Scopus数据库获得2006~2015年间发表的预后相关的系统评价/Meta分析文献，利用R软件、tm程序包、ggplot2程序包以及VOSviewer软件进行文献计量学分析、简单的文本挖掘及相关可视化展示。
关键词： 预后 系统评价/Meta分析 文献计量学 文本挖掘 可视化 -
基于文本挖掘技术分析治疗精液不液化症的中医用药规律
目的:利用文本挖掘技术,探索中医治疗精液不液化症的中药用药规律,为临床治疗提供一定的参考.方法:登录中国知网(CNKI),利用关键词检索中医治疗精液不液化症的相关文献.利用文本提取技术,建立MySQL数据库,运用全文索引对数据进行归档存储,并进行人工降噪.利用文本挖掘中的关联规则Aprior算法,进行统计分析.建立常用中药频次表和中药一维文本挖掘结果的表格,利用Cytoscape软件绘制中药协同关系二维文本挖掘图并进行分析讨论.结果:中药协同关系分析显示黄柏、甘草、茯苓、丹参、知母是治疗精液不液化症复方配伍的核心.结论:文本挖据技术的分析结果,充分体现了以扶正祛邪、恢复气化功能为原则论治精液不液化症的用药特色,对提高临床治疗治疗精液不液化症的疗效大有裨益.
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文本挖掘注射用双黄连不良反应的相关因素
目的 利用文本挖掘技术探索注射用双黄连不良反应发生的相关因素.方法 在中国生物医学文献服务系统中收集双黄连文献数据,采用基于敏感关键词频数统计的数据分层算法,挖掘数据集中原料、检测、功能、临床及不良反应等方面的信息,将结果通过Cytoscape软件构建网络图.结果 有关注射用双黄连的文献研究主要集中于不良反应和检测指标方面,双黄连注射液不良反应的核心症状是皮疹、高热、头痛、胸闷和荨麻疹；其需要检测的主要指标为内毒素(脂多糖)、组胺和致敏原.双黄连注射剂中的主要成分是黄芩苷、绿原酸和连翘酯苷A.结论 利用文本挖掘总结注射用双黄连不良反应是一种新的探索和尝试；有关双黄连注射剂引发过敏或类过敏反应的机制尚待深入和系统的研究.
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基于文本挖掘技术分析西药和中成药治疗再生障碍性贫血的规律
目的 利用文本挖掘技术探索西药、中成药治疗再生障碍性贫血的规律.方法 在中国生物医学文献数据库中收集治疗再生障碍性贫血的相关文献,建立Access数据库,运用SQL数据平台处理数据,并结合人工降噪,分析西药、中成药的用药规律.结果 司坦唑醇、环孢素A、抗胸腺细胞球蛋白、环磷酰胺、抗淋巴细胞球蛋白等为文献中出现的高频西药,复方皂矾丸、再障生血片等为文献中出现的高频中成药.结论 利用文本挖掘的方法,从文献报告频数方面呈现了西药、中成药治疗再生障碍性贫血的用药规律,尤其是西药、中成药联合应用还值得进一步研究.
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利用文本挖掘分析手足口病中西医治疗现状
目的 研究手足口病中西医治疗规律.方法 在中国生物医学文献服务系统中收集治疗手足口病文献数据,采用基于敏感关键词频数统计的数据分层算法,挖掘数据集中证候、症状、中药,以及中成药和西药联用规律.这些结果通过一维频次及构建网络图进行展示.结果 手足口病的证候多与热、湿、毒因素相关；核心症状是发热、疱疹和口腔溃疡；中药治疗以金银花、连翘、生石膏、竹叶、淡竹叶、甘草、大青叶、黄芩等为核心用药；中成药常用的是清开灵、双黄连、痰热清,康复新液常用于口腔溃疡的治疗；西药以抗病毒为原则,利巴韦林常用；中成药与西药联用常用的方案是利巴韦林加痰热清.结论 利用文本挖掘总结手足口病中西医治疗方法是一种新的探索和尝试.
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利用文本挖掘技术和生物信息学方法研究鹿茸生物学功效
目的 利用文献数据文本挖掘技术结合生物信息学分析方法,从基因表达谱角度探索鹿茸的生物学功效.方法 首先对中国知网、万方数据库和维普数据库三个常用的中文数据库中关于鹿茸的基因表达调控作用的相关文献进行挖掘,提取基因表达数据,进行数据清洗、标准化.其次,通过Cytoscape制作蛋白相互作用网络,再利用自主研发的“疾病-基因-化合物”分析平台进行关联分析,得到鹿茸的适应证和禁忌证.使用DAVID工具对鹿茸基因表达数据进行KEGG通路功能富集分析,筛选出相应的生物学通路及靶点.后,通过查阅鹿茸药理学作用相关古籍、文献验证本方法的准确性.结果 本文共挖掘到鹿茸相关调控基因30个,其中上调基因21个,下调基因9个;制作出鹿茸相关调控基因蛋白互作网络;关联分析找到十几种鹿茸的适应证和禁忌证;KEGG通路富集分析找到鹿茸在抗肿瘤、抗感染、提高免疫力三个功效方面的作用通路及靶点.结论 文本挖掘结合生物信息学方法是一种研究中药药理机制及功效的新方法.
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文本挖掘探索泌尿系感染中西医用药规律
目的 利用文本挖掘技术探索泌尿系感染中西医用药规律.方法 在中国生物医学文献服务系统中收集治疗泌尿系感染文献数据,采用基于敏感关键词频数统计的数据分层算法,挖掘泌尿系感染中成药、西药、中成药与西药联合应用规律,并利用Cytoscape2.8软件进行可视化展示.结果 中成药的应用以清热解毒、利尿通淋为主；西药以抗菌治疗为主；具有清热解毒、利尿通淋之功的中成药常与抗菌药联合应用.结论 文本挖掘能够比较客观地总结疾病用药规律,为临床应用提供有益的探索和参考.
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中医药文献数字化研究进展
中医药文献是中医药文化的重要载体之一，记载着历代医家的智慧和经验。中医药文献的数字化对于中医药知识遗产的保存、传播、开发与利用具有重大意义。回顾中医药文献数字化的发展历程，对文献标引、文献检索、文本挖掘等技术在中医药领域的应用现状进行了综述，讨论了存在的问题和发展趋势。
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自助挂号信息导引系统研究
研究完善了专科、专家、专病等数据库，利用文本挖掘和D3技术搭建了自助挂号指南系统，使患者可以根据症状准确选择对症专科专家进行挂号，极大提高了患者网络预约和自助挂号的准确率，减少挂错号及退号现象，从而提高医院门诊效率。此外，系统还可进行护士的岗前培训和测验，规范护士分诊流程。
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国医大师洪广祥教授治疗哮喘经验挖掘分析
目的:挖掘与总结名老专家洪广祥教授临床辨治哮喘病的学术思想和证治规律.方法:以2008年5月-2009年10月就诊的72例洪教授治疗哮喘医案为分析对象,采用文本挖掘技术进行分析.数据分析在SAS 9.1.3平台上进行,进行频数统计、证候治法分析、中药关联分析、中药因子分析等处理,了解洪教授治疗哮喘的核心药物组方、证候分类规律、中药配伍规律.结果:(1)72例哮喘病患者出现证候多为气阳虚弱、痰瘀阻肺等;(2)中药关联规则分析提示哮喘的核心组方为:黄芪、防风、白术、桂枝、白芍、生姜、甘草、红枣、葶苈子、陈皮、青皮、卫矛、牡荆子、槟榔、大黄、麻黄、苏叶、半夏;(3)中药因子分析可将治疗哮喘常用药物分为6个组合,分别具有益气固表、温阳护卫、宣肺平喘、化饮止咳和清泻肺热等功效.结论:深入挖掘名老中医有效医案的证治规律,有利于提高临床医生诊治水平.数据挖掘结果客观反映了洪广祥教授治疗哮喘病的临床思路与经验.
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基于复杂关联网络的生物医学研究结构的挖掘
基于免费开放的PubMed文献数据集，利用文献的知识发现，通过挖掘文献中隐含的关联，构建了生物医学实体关联演化网络。它能帮助科研人员形成新的科学假设，分析关联网络的拓扑特征，从系统层面上研究科学文献富集的知识结构、相关性与发展规律，为文献的知识发现引入新的视角与方法，提高知识发现的效率。
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黄精化合物对固齿的作用
以Swanson提出的开放式知识发现方法为基础,结合情报学的类比推理方法挖掘黄精化合物与补肾固齿关系的题录,找出黄精具有促进牙周组织细胞增殖或抑制阻止增殖的关联因子,明确黄精固齿的途径机理,完善其促牙周组织增殖、抗牙龈萎缩而固齿的假设模型,推导黄精多糖等促进牙周膜细胞的成骨作用.
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基于文本挖掘的高通量癌症基因组数据注释
癌症基因组学科学计划的实施，推进了分子层面疾病诊断、疾病预防检测和靶向治疗等临床应用，积累了大规模的癌症基因组学数据，对癌症基因组数据进行有效挖掘和利用，成为该领域的研究重点。在高通量癌症基因组学数据挖掘的基础上，以美国国家癌症研究中心的癌症基因组数据为研究对象，利用文本挖掘技术对特异癌症基因加以注释和可视化展示，即从基因功能描述文本中识别疾病实体和药物实体，从临床应用的角度注释高通量数据挖掘结果，便于研究人员从高通量的数据和科学文献中发现疾病、药物及基因之间的关系。
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构建基于文献信息网络的知识发现系统应用模型的设想
文献检索能够帮助用户快速地查找与获取目标文献,但非结构化的文献仍然需要人工阅读才能获得有效的知识,严重限制了从大量文献中发现知识的效率.基于文献的知识发现研究是通过文献集中潜在的关联发现来形成科学假设,因此利用文本挖掘技术将非结构化的文献集转化为图结构模型,对进一步知识发现的实施与深入挖掘都具有重要作用.有鉴于此,我们利用复杂网络的方法对文献集进行文本挖掘,探讨了关联知识的图结构组织对文献知识发现的重要作用,揭示了非相关文献中的隐含知识,并构建了文献信息网络的知识发现应用模型.
