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复杂网络模型在传染病预防控制中的应用
为探讨复杂网络模型在传染病预防控制中的应用,根据复杂网络的基本属性,利用网络模型和常用软件分析传染病传播过程.相对于传统的流行病学方法,复杂网络的理论不仅能描述传染病动态传播过程,也能进行传染病预测.通过复杂网络的理论来研究疾病的传播,能深入理解到网络的拓扑结构对疾病传播有重要影响,从而找到控制疾病传播的更有效的方法.
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基于复杂网络分析的输卵管性不孕症中药用药规律分析
目的 以现代文献研究的方法,分析中药治疗输卵管性不孕症的用药特点.方法 对2006 ～ 2015年的相关临床研究文献进行检索,应用Excel软件对所用中药建立数据库,运用中医复杂分析系统软件对所用中药进行复杂网络分析.结果 纳入文献167篇,出现频率≥5％的药物54味,治疗核心药物是当归、赤芍、穿山甲、丹参、川芎、路路通、桃仁、三棱、莪术、香附.结论 通过复杂网络分析中药治疗输卵管性不孕症的用药规律,说明该病病机为血瘀,治疗以活血化瘀为主,体现了辨病与辨证相结合的思路,为临床治疗提供了一定参考依据.
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基于脑缺血动物模型的针刺作用机制及选穴规律的挖掘研究
目的 运用数据挖掘方法 分析针刺实验文献中针刺对脑缺血动物模型的分子生物学作用机制的选穴规律.方法检索1978年1月-2015年12月中国期刊全文数据库(CNKI)、中国生物医学文献数据库(SinoMed)、万方科技数据库有关针刺动物实验的文献,筛选出与针刺对脑缺血动物模型基因蛋白表达影响相关的文献,人工提取文献中的穴位和基因蛋白指标,规范化处理后进行频次统计、关联规则及复杂网络计算分析并可视化展示.结果 获得符合研究范围的文献350篇;获得穴位79个,频次高为百会;获得基因蛋白180个,频次高为BCL2;关联规则计算得常用组穴为足三里、曲池;复杂网络计算得与脑缺血损伤或康复机制关系较密切的基因/蛋白为热休克蛋白70、BCL2、CASP3、BCL2相关X蛋白.结论 针刺穴位可通过多条途径治疗缺血性脑血管疾病,穴位选择主要以督脉和阳明经的穴位为主.
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缺血性中风证候要素动态演变的复杂网络分析
目的 探索缺血性中风证候要素在不同时间节点的动态演变.方法 以缺血性中风住院患者为对象,采集患者入院时、发病第14天、发病第30天的证候要素,应用关联分析法,构建复杂网络,采用层次结构核心算法,抽取缺血性中风证候要素核心关系网络,分析证候要素在不同时点的动态演变.结果 共纳入缺血性中风患者60例,患者入院时证候要素以风证、痰证、血瘀证为主;发病14天、发病30天均以痰证、血瘀证为主.在具体表现方面,入院时以病情数变、神情躁扰不宁、发病即达高峰、高黏滞血症、脉细或细数等表现为主;发病14天时以脉滑或濡、脉弦、舌紫黯为主;发病30天时以高黏滞血症、脉滑或濡、脉弦、舌紫暗为主.结论 缺血性中风证候要素在不同时点呈现动态演变,痰证、血瘀证贯穿了病程始终,并随着病程的进展逐步显现.
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基于复杂网络分析中医药自拟方治疗缓慢性心率失常用药规律
目的 主要分析中医药自拟方在治疗缓慢性心率失常研究中的用药规律,为临床防治心动过缓提供可借鉴的治疗思路.方法 计算机全面检索中国生物医学文献数据库(CBM)、中国知网数据库(CNKI)和万方数据库,获得中医药治疗缓慢性心率失常的文献,并手动筛选出以中医药自拟方治疗缓慢性心率失常的相关文献.采用BICOMB 2分析软件对所有中药信息进行抽取和整理并生成共现矩阵,采用NetDraw绘制网络图谱进行分析.结果 共纳入669篇中药自拟方治疗缓慢性心率失常的文献,整理出906条自拟方,包含227味中药,其中炙甘草出现频率多(557次),其次为附子(489次)、桂枝(480次)、黄芪(453次)、丹参(377次)、人参(352次)、麦冬(312次)、细辛(309次)、当归(286次)、麻黄(254次);按功效分类后,补虚药(51味)、清热药(33味)、活血化瘀药(25味)、化痰止咳平喘药(22味)共占总药味的47.29％,处于主要地位.结论 临床用于治疗缓慢性心率失常的中药种类较多,但有规律可循,许多高频中药或药对可直接配伍成相关的中成药以及经典方,体现了临床实践、经验传承和新药研发的关联性.
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基于临床医疗科研信息共享系统AECOPD证症相关性分析研究
目的：利用复杂网络开展慢性阻塞性肺疾病急性加重期（AECOPD）证症相关性分析研究，为AECOPD证候诊断标准的修订提供科学依据，并探索有关技术方法的推广应用。方法：利用当前我院临床医疗科研信息共享系统，开展大数据（2011年8月~2013年1月间3000份格式化电子病历数据）导入数据库，通过ETL软件进行数据处理，运用复杂网络进行数据挖掘。获取AECOPD常见证候常见症状的相关度MISCR值（证候与症状的相关性），并与现有标准对比分析。结果：痰热壅肺、肺肾气虚、痰浊阻肺等各证候对应的症状群与现有标准对应分析发现临床所见证候多虚症、实症夹杂，但个别症状与对应的证候相矛盾。结论：基于临床医疗科研信息共享系统，开展AECOPD证症相关性分析研究，为中医证候诊断标准的验证和修订提供有力的证据和方法学研究。
关键词： 临床医疗科研信息共享系统 证候分布 证症相关性分析 复杂网络 -
王素梅治疗多发性抽动症方药配伍的复杂网络法分析初探
目的:利用复杂网络分析方法,分析王素梅教授治疗多发性抽动症的核心方药.方法:选取王素梅教授治疗多发性抽动症病例102份病历共757诊次,将全部病例录入结构化临床诊疗信息采集系统,转化为可分析的数据,利用复杂网络分析算法和复杂网络分析系统进行中药配伍规律研究.结果:王素梅教授治疗本病的核心方药组,一组为防风、地龙、木瓜、葛根、伸筋草、菊花、谷精草、陈皮、胆南星、半夏等熄风通络、平肝化痰药物,另一组由茯苓、白术、山药组成,具有益气健脾的作用.结论:本法可揭示名老中医的核心经验方药,从而进一步分析专家对本病病机的认识及辨证思路,运用现代科学技术整理总结名老中医经验更具有客观性.
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基于复杂网络的穴位-分子生物学效应研究
目的:探索针刺实验文献中穴位生物学效应的分子机制,为临床及实验研究提供方法参考.方法:检索《中国知网》(CNKI)、《万方数据资源库》和《中国生物医学文献数据库》(CBM)三大数据库中的针刺动物实验文献.筛选出单纯针刺对动物机体内相关基因表达影响研究的文献,按文献纳入标准和排除标准选择、整理文献.采集文献中的有效穴位及相应的基因名称,运用Python编程语言编写的软件、Cytoscape3.3.0软件及MECODE复杂网络算法进行统计分析.结果:获得符合研究的文献2136篇,穴位233个,分子793个;频次排在前十的穴位为足三里、百会、内关、水沟、大椎、三阴交、肾俞、曲池、风府、阳陵泉;频次排在前十的分子有:BCL2、FOS、BDNF、Bax、CASP3、TNFA、GFAP、NGF、HSP70、IL1B;频次排在前五的穴位配伍有大椎-百会、水沟-百会、百会-足三里、三阴交-足三里、内关-水沟;穴位足三里处于穴位-基因网络的中心位置;通过复杂网络的模块分析发现,一些穴位与一些通路相关的基因落入同一网络模块中.结论:本研究发现足三里穴是针刺实验研究的常用穴位,足阳明胃经可能与代谢通路关系密切,这一发现可为临床及实验研究提供新的研究思路.
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复杂系统熵网络方法及其在中医肿瘤临床数据挖掘中的应用
目的:探索中医治疗肿瘤复杂临床数据挖掘的研究方法.方法:采用基于随机置换检验的互信息方法进行多维的相关性评估,在此基础上建立复杂网络,通过计算网络的各种统计信息对复杂中医肿瘤临床数据进行挖掘,并对龙华医院718例肺癌数据进行了挖掘分析.结果:中医治疗肿瘤临床数据中的多因素混杂交互效应,对718例数据分析结果得到116对有协同效应的属性,82对有拮抗效应的属性,14个核心协同效应子群属性集,7个核心拮抗效应子群属性集,分析结果基本符合临床实际情况.结论:复杂系统熵网络方法能够对复杂中医临床数据进行挖掘,是进行多因素交互效应分析的有效方法之一.
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基于计算的中药靶点预测研究探讨与实验分析＊
鉴于药物微观作用具有的基本网络调控特性，网络药理学已经成为药物机理研究和新药研发的新思路。本文从计算方法的角度对网络药理学的核心研究内容之一：药物靶点关系及其预测的分析方法进行综述，在此基础上，总结了近年来药物靶点预测分析方法所遵循的一般原理和步骤。鉴于中药成分的多样性、药物的整体调控能力和高质量药理数据的缺乏等问题，中药面向靶点网络的调控机理研究具有更大难度。因此，本文还探讨了中药药物靶点预测分析研究的主要难点与研究趋势。后，结合实际整合后的中药网络数据、化学结构相似性计算和链接预测方法，应用一种基于复杂网络的中药靶点预测分析方法进行了示范实验研究，并探讨中药靶点预测分析的重点研究方向。
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中医临床医疗科研信息共享系统的智能整合及应用
为探索以数据库为核心数据智能整合，以数据挖掘为核心的知识发现等智能整合及应用。在现有临床科研信息共享平台基础上，从结构化电子病历智能整合、数据整合、多种数据挖掘方法整合等方面阐述。以慢性阻塞性肺疾病急性加重期证候分布及证候诊断标准的验证方法学研究为示范研究，进行数据整合，利用水晶报表和复杂网络智能优化，挖掘出证-症、病-证-中药关联度。以上分析说明基于共享系统，根据研究方案，数据智能整合，挖掘方法的智能整合，提高共享平台的应用功能，实践证明是可行的。
关键词： 中医临床医疗科研信息共享平台 数据挖掘 水晶报表 复杂网络 -
基于可视化图方法的体征时间序列数据分类分析研究
目的:本研究采用复杂网络理论研究体征时序数据,使用网络特征刻画体征时序数据的动态特征,分析网络特征与人体生理系统健康状态的关系.方法:本文采用可视化图方法将标准心率时序数据和穿戴设备采集的老年人心率等体征时序数据网络化,提取网络特征,采用决策树分类方法分析网络特征与心脏疾病和年龄因素关系.结果:决策树模型对心脏疾病和年龄因素有较好的分类结果,标准心率时序数据的分形特性使网络度分布为幂律分布,网络图密度特征是与心脏疾病和年龄因素相关的主要因素.结论:网络拓扑结构继承体征时序数据的动态特性并将之体现在网络特征上.体征时序数据的动态特性和网络特征的对应关系还待进一步研究阐明.
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基于数据挖掘的溃疡性结肠炎核心药物及配伍分析
目的：挖掘治疗溃疡性结肠炎的核心方药，探索其用药规律。方法：选取江苏省中医院2009~2013年间525份溃疡性结肠炎住院病历，将病历录入结构化临床诊疗信息采集系统中，经数据整理和规则处理后，采用复杂网络方法，分析中药处方的核心药物及常用配伍。结果：治疗溃疡性结肠炎的核心药物为地榆、黄连、木香、白芍、仙鹤草、当归、炒白术、黄芩、紫草、薏苡仁、茯苓、山药。结论：数据挖掘可以客观分析治疗溃疡性结肠炎核心药物及常用配伍，指导临床处方用药。
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基于复杂网络的薛伯寿教授临床处方用药规律分析研究
目的:如何从中医药学长期医疗实践中积累的大量处方数据中进行知识发现是中医药现代化研究的重要内容之一.本研究拟从薛伯寿教授多年临床实践的处方数据出发,探索基于复杂网络的中药网络与处方网络相结合发现薛教授常用复方核心药物组合的方法.方法:基于薛教授在中国中医科学院广安门医院门诊系统中的9 584个处方数据,依据处方构成的相似性和药物的同现关系分别构建处方网络和药物网络,利用社团分析等复杂网络方法进行处方及药物配伍分析,由薛老及其传承人评价分析结果.结果:通过复杂网络分析,得到126个处方模块,4个中药模块.其中,1个处方模块的核心药物组合为小柴胡汤、银翘散、升降散复方加减,与前期利用完整回顾性医案挖掘的外感热病处方中药组成一致.结论:针对处方数据,利用社团分析等复杂网络方法具有一定的优势,可以得到薛教授治疗不同疾病的常用复方核心药物组合,可为进一步继承和挖掘名老中医临床经验方提供基础.
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基于临床医疗科研信息共享系统中医病-证-中药关联分析方法的研究
目的：基于临床医疗科研信息共享系统，以慢性阻塞性肺疾病急性加重（AECOPD）病-证-中药研究为示范，探索建立一套中医多病种病-证-中药研究方法，指导临床实践。方法：利用我院临床医疗科研信息共享系统构建数据库（数据来自2011年8月~2013年3月间5000份格式化电子病历），数据预处理，运用水晶报表及复杂网络进行数据挖掘，获取AECOPD病-证-中药的频度关系，分析AECOPD不同证型临床用药特点。结果：痰热壅肺、痰瘀阻肺、肺肾气虚3个证候对应的中药均有甘草、陈皮、地龙、紫苏子、黄芩、红花等，痰热壅肺证除有清热、化痰药还有活血药，肺肾气虚证除有益气补肺肾药外兼有活血化痰药。结论：利用临床共享系统可用于临床大数据的处理，挖掘的结果可用于指导临床实践，为中医临床科研提供很好的平台。
关键词： 临床医疗科研信息共享系统 中医证候 水晶报表 复杂网络 -
基于复杂网络分析现代文献报道的中医周期疗法治疗多囊卵巢综合征的用药规律
目的：通过现代文献研究，分析中医周期疗法治疗多囊卵巢综合征（PCOS）的用药特点，为提高 PCOS 的临床疗效提供依据。方法：对2000—2014年的相关临床研究文献进行检索，应用 Excel 软件，对周期治疗 PCOS 中所用中医复方及其药物建立数据库，运用 SPSS 对数据进行处理，使用复杂网络挖掘中医周期疗法中治疗 PCOS 的核心药物，分析其用药特点。结果：1）符合纳入标准的文献有51篇，其中41篇分4期治疗，10篇分3期治疗，共涉及药物151味，出现频率≥2％有当归、菟丝子、熟地黄、山药、香附、淫羊藿、川芎、山茱萸、丹参、枸杞子、茯苓和苍术。2）分期治疗常用配伍组合的药物（关联频度≥20％）依次为：经后期：当归、菟丝子、熟地黄、山药、淫羊藿、女贞子、枸杞子、山茱萸、香附、何首乌；经间期：当归、菟丝子、熟地黄、丹参、红花、山药、山茱萸、桃仁、川芎、赤芍、白芍、茯苓、香附、皂角刺、淫羊藿；经前期：当归、菟丝子、熟地黄、山药、淫羊藿、枸杞子、肉苁蓉、山茱萸、川断、何首乌、杜仲、香附；行经期：当归、赤芍、益母草、泽兰、香附、丹参、川芎、红花、桃仁、熟地黄。结论：通过复杂网络分析所获得的临床报道所用中医周期治疗 PCOS 的用药规律，体现了该病病理因素主要是（阳）虚、血瘀和痰湿；病位主要肾、肝、脾。分期治疗治法分别为：经后期以补肝肾，滋阴养血，理气健脾为主；经间期以补肝肾，理气活血为主；经前期以补肾升阳、健脾理气为主；行经期活血滋阴为主，可为进一步指导临床用药提供一定的指导。
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用复杂网络分析史大卓教授治疗介入后 冠心病用药规律
目的:采用复杂网络挖掘技术分析史大卓教授辨治介入后冠心病的用药规律.方法:利用冠心病中医临床科研信息共享平台收集史大卓教授诊疗介入后冠心病的证候、中药信息,采用复杂网络挖掘技术分析史大卓教授治疗介入后冠心病的用药规律.以中药、证候、功效作为网络节点,构建中药-中药、证候-中药、功效-功效关系的复杂网络结构图.结果:以中药-中药为节点进行复杂网络分析显示,主要中药节点为丹参、生黄芪、川芎、莪术、赤芍、黄连、三七粉、金银花;以证候-中药为节点进行复杂网络分析显示,血瘀对应的主要中药节点是赤芍、丹参、莪术、川芎、红花、三七粉,气虚对应的主要中药节点是生黄芪、党参、西洋参,痰浊对应的主要中药节点是瓜蒌、薤白、半夏、陈皮、茯苓,热毒对应的主要中药节点是黄连、金银花、黄芩;以功效-功效为节点进行复杂网络分析显示,中药功效主要节点是益气、活血、化痰、解毒、安神.结论:史大卓教授善于应用益气活血解毒类中药治疗介入后冠心病,核心组方是丹参、生黄芪、川芎、莪术、赤芍、黄连、三七粉、金银花.
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基于图论的智能针灸机器人取穴原理研究
随着医疗机器人技术及通用人工智能技术的迅猛发展,标准化、智能化已经成为了现代医学发展的主流趋势.我团队自主开发了基于数字经络理论的智能针灸机器人,具备基于经穴主治与症状联系的小世界网络自动配穴这一核心功能,我们运用基于模块度优化的启发式社区发现算法,对腧穴-主治网络进行了较为系统的研究,并通过进一步的开发,初步实现了基于图论的针灸智能取穴功能.
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基于复杂网络的心绞痛血瘀证中药组方研究
作者基于中医临床文献数据，从临床治疗心绞痛血瘀证的方剂出发，使用复杂网络算法构建了中药网络，计算了中药的点中心度（degree）、中间中心度（betweenness centrality）和接近中心度（closeness centrality），以及使用凝聚子图CONCOR迭代相关收敛法分析了中药的聚类情况。结果发现丹参、川芎、黄芪、红花、赤芍的点中心度、中间中心度和接近中心度都较高，为治疗心绞痛血瘀证的核心药物。聚类结果显示，中药可聚类为27个子群，其中4个子群（中药组合）在中药新药处方筛选上有一定的应用价值。为了分析处方内部中药可能的配伍关系，作者对子群进行了二级凝聚子群分析，进一步计算了二级子群的密度，并结合中医理论给出了解释。结论：复杂网络算法可以有效辅助治疗心绞痛血瘀证中药组方的研究。
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基于复杂网络社团结构划分的古代治疗面瘫腧穴配伍规律研究
目的:分析古代针灸治疗面瘫的腧穴配伍规律及其处方的优化.方法:在全面收集古代针灸治疗面瘫的文献基础上,构建古代面瘫针灸处方数据库,采用复杂网络二分网络社团结构划分的方法,分析古代针灸治疗面瘫的腧穴配伍规律特点,并对处方优化进行研究.结果:古代针灸治疗面瘫的核心穴位多以水沟、地仓、颊车、合谷、风池、足三里、内庭、听会、承浆、上关为主.核心穴对多以地仓、颊车、水沟、风池、内庭、合谷、足三里、列缺、上关、二间之间相互配伍.优化处方核心组成以听会、风池、风市、悬钟、地仓、颊车、足三里、大椎、百会、曲池、肩髃、发际为主,选穴分布多以胃经、大肠经、督脉为核心.头面部腧穴的使用频率明显高于其他部位;选穴配伍多以特定穴为主,其中以交会穴使用频繁.结论:局部选穴是古代针灸治疗面瘫的首选,特定穴是古代针灸治疗面瘫处方中的核心用穴.
