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丙型肝炎基因型与干扰素疗效的关系
干扰素能有效地治疗部分丙型肝炎(HCV),据国内外资料报告[1],丙肝病毒存在多种基因型,不同基因型感染的地理分布、临床特征、其对干扰素治疗的反应性及转阴均有明显差异.我们对52份HCV-RNA阳性血清进行基因分型,旨在探讨HCV基因型与干扰素疗效的关系.
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丙型肝炎自然史
丙型肝炎由丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCv)感染引起,感染者呈全世界分布.丙型肝炎病毒有6种主要的基因型,感染在献血或吸毒人群中多见,感染后少数患者发生病毒的自发性清除,未清除者病情容易慢性化,可能进一步发展为肝硬化、肝癌,危害着人类的健康.目前,多个对丙型肝炎自然史及其影响因素的研究结果出现了不一致性,其中饮酒是影响疾病进展非常重要的因素.
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干扰素治疗丙型肝炎疗效预测因素的研究
目的：探讨能预测干扰素疗效的因素。方法：分别应用引物特异PCR法、信号引物能量转移技术、薄板层析技术、放免法及APAAP免疫桥联酶标法检测20例慢性丙型肝炎HCV基因型及干扰素治疗前后血清HCV-RNA 水平，β2 微球蛋白，2′-5′寡腺苷酸合成酶活性及外周血淋巴细胞亚群。结果：（1）疗前HCV-RNA量低者及治疗和随访过程中HCV-RNA量持续降低者对干扰素治疗反应好。（2）HCV-Ⅲ型患者对干扰素完全应答率高于HCV-Ⅱ型，P＜0.05。（3）疗前2′-5′寡腺苷酸合成酶活性低者对IFN治疗反应好。（4）治疗前后血清β2 微球蛋白水平无显著变化，疗前不同应答组β2 微球蛋白水平也无显著差异。（5）治疗后外周血CD+3，CD+4及CD+4/CD+8升高，完全应答组疗前CD+3，CD+4及CD+4/CD+8较部分应答及无应答组高，但无统计学差异。结论：IFN治疗前HCV-RNA水平、HCV基因型、2′-5′寡腺苷酸合成酶活性测定可作为预测IFN疗效的指标。治疗期间及随访过程中血清HCV-RNA水平变化对IFN疗效评价有重要意义。疗前β2 微球蛋白水平及淋巴细胞亚群检测不能作为预测IFN疗效的指标。
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丙型肝炎病毒的检测与临床应用
丙型肝炎病毒(HCV)感染导致的慢性丙型肝炎(CHC)在全球发病率较高.不同的HCV检测方法之间存在分析报告的敏感度、特异度的差异,尤其是HCVRNA定量检测.该文就HCV检测技术的进展及其在临床应用的现状作一综述,以帮助临床医师选取高灵敏度的检测方法,提高HCV RNA检测结果的准确性及安全性,对于患者的诊断和治疗非常重要.
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昆明地区丙型肝炎基因型分析
HCV是造成慢性肝炎、肝硬化及肝癌的重要原因之一.现研究已知HCV基因组高度的变异性是HCV持续感染及严重预后的重要因素,且HCV基因型与感染途径、临床病情及抗病毒治疗、疫苗制备等有明显的相互关系.根据HCV基因的遗传差异性可将HCV分为不同的基因型和亚型.根据HCV基因型可以明确病毒的种系发育和传播来源,了解不同基因型和亚型的地理分布,可能与HCV治疗的疗程及效果相关[1].因此,针对当地流行的HCV基因型进行检测鉴定,具有重要的临床意义.本研究即以型特异性探针杂交法对176例HCV感染者进行HCV基因型研究,以探讨昆明地区HCV感染基因型流行特征.
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聚乙二醇化干扰素-α对不同基因型慢性丙型肝炎患者治疗效果比较
目的 观察应用聚乙二醇化干扰素-α(peg-IFNα)治疗丙性肝炎病毒(HCV)基因I型和非HCV I型感染的慢性丙型肝炎(CHC)患者的疗效差异.方法 2013年10月～2016年10月在我院治疗的108例CHC患者,其中HCV I型感染者58例,非HCV I型感染者50例,均接受peg-IFNα-2a联合利巴韦林治疗48周,停药后随访24周.采用荧光定量RT-PCR法检测血清HCV RNA,采用一步法聚合酶链式反应结合TaqMan技术和HCV分型特异性引物进行HCV基因分型.结果 治疗前,两组基线年龄、性别比例、体质指数(BMI)、血清ALT和HCV RNA水平比较,无显著性差异(P>0.05);非HCV I型感染者快速病毒学应答(RVR)、早期病毒学应答(EVR)、治疗结束时病毒学应答(ETVR)和持续病毒学应答率(SVR)分别为74.0％、82.0％、88.0％和86.0％,均显著高于HCV I型感染者(分别为51.7％、60.3％、63.8％和58.6％,P<0.05);67例获得RVR患者SVR发生率为100.00％,显著高于41例未获得RVR患者的25.6％(P<0.05),76例获得EVR患者SVR发生率为94.7％,也显著高于32例未获得EVR患者的15.6％(P<0.05);在血清HCV RNA≤4×105 IU/ml被认为系低病毒载量组,HCV I型与非HCV I型感染者各病毒学应答率无显著性相差(P>0.05),而在血清HCV RNA>4×105 IU/ml被认为系高病毒载量组,39例非HCV I型感染者RVR、EVR、ETVR和SVR分别为71.8％、79.5％、87.2％和84.6％,均显著高于44例HCV I型感染者(分别为50.0％、59.1％、63.6％和74.4％,P<0.05);治疗24周、48周和随访24周时,非HCV I型感染者生化学应答率分别为70.0％、80.0％和84.0％,显著高于HCV I型感染者的50.0％、60.3％和69.0％(P<0.05).结论 聚乙二醇化干扰素-α联合利巴韦林治疗非HCV I型CHC患者效果较好,获得RVR和EVR的患者将获得SVR,应坚定治疗,而对HCV I型感染者、血清病毒载量较高和未获得RVR和EVR的患者,则应今早作出更改治疗方案的选择.
关键词： 慢性丙性肝炎 HCV基因型 聚乙二醇化干扰素-α 利巴韦林 疗效 -
慢性丙型肝炎患者年龄和感染方式对抗病毒治疗应答的影响
目的 探讨患者年龄和感染方式与慢性丙型肝炎患者抗病毒疗效的关系.方法 应用聚乙二醇干扰素联合利巴韦林治疗113例慢性丙型肝炎患者.采用实时荧光PCR法检测血清HCV RNA定量；采用CE1区测序遗传树比对分析法检测HCV基凶型.结果 在20例有静脉吸毒史的患者,获得持续病毒学应答率(95.0％)明显高于54例医源性感染患者(75.9％,P＜ 0.05)和39例既无静脉吸毒史又无明显医源性感染患者(69.2％,P＜0.05)；在年龄≤40岁的患者,获得持续病毒学应答率(82.9％)明显高于年龄＞ 40岁的患者(65.1％,P＜0.05)；有静脉吸毒史的患者主要感染HCV3型(45％)和6型(50％),而医源性感染组和其他组感染HCV1b型的比例分别为51.9％和43.6％；在无静脉吸毒史的患者中,年龄≤40岁组患者感染非HCV1型(2型、3型和6型)的比例达64.7％,而年龄＞ 40岁组患者感染HCV1型的比例达64.3％.结论 慢性丙型肝炎患者年龄及感染方式可作为判断感染病毒基因型的参考指标,对抗病毒治疗的疗程确定和疗效预测有一定的意义.
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普通干扰素1b联合利巴韦林治疗非1b型慢性丙型肝炎患者临床观察
目的 探讨不同基因型HCV感染者对普通干扰素联合利巴韦林治疗的疗效.方法 应用型特异性探针杂交法检测106例慢性丙型肝炎患者HCV基因型.应用普通干扰素联合利巴韦林治疗,观察病毒学应答情况.结果 在106例患者中,以HCV 3b(45.3％)、1b(20.8％)和3a(18.9％)型为主,6a(9.4％)和2a(5.7％)型次之；在22例1b型感染者,只有9例接受本治疗方案,82例非1b型感染者完成治疗.非1b型患者的RVR和EVR分别为50％和86.6％；在1b型HCV感染者,22.2％(2/9)获得SVR,而非1b型HCV感染者,76.8％(63/82)获得SVR.结论 普通干扰素联合利巴韦林治疗非1b型慢性丙型肝炎患者疗效较好.
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芯片技术对南昌地区HIV-HCV合并感染者的HCV基因型研究
目的：了解芯片技术对南昌地区HIV-HCV合并感染者的HCV基因型分布。方法2008年10月至2013年11月期间，在南昌地区就诊的285例HIV感染患者进行HCV筛查，并对HCV阳性患者的基因型进行芯片技术检测，将其检测结果与测序结果进行比对；同时对HIV-HCV合并感染者进行流行病学调查。结果芯片技术可检测出约900拷贝/ml的丙型肝炎病毒的基因型，HIV感染者中，HCV阳性比率为19.3%，HIV-HCV合并感染者的HCV基因型分布情况为1b型41例，2a型9例；3b型1例,6型1例，还有1 b+2a型3例；芯片检测结果与基因测序结果完全一致。结论芯片技术灵敏度高，准确性好，HCV基因型分布以1b基因型为主，其次为2a型；HIV感染者的感染传播途径有了新变化，性传播感染HIV比例在增加，但性传播合并感染的比例较低。
关键词： 芯片技术 HIV-HCV合并感染 HCV基因型 -
血清中不同基因型丙型肝炎病毒RNA含量的测定
目的了解血清中不同基因型丙型肝炎病毒HCV-RNA的含量.方法用实时荧光定量RT-PCR和逆转录型特异性引物PCR同时检测21例费城酒精依赖丙肝患者的血清HCV-RNA拷贝数并分析HCV基因型.结果 21份血清标本中,有17份为HCV RNA阳性.这些阳性血清的HCV RNA含量波动范围在104.60～106.20拷贝/ml.检测到1a和1b两种HCV基因型,其中1a型7例,RNA平均滴度为105.28±0.75拷贝/ml,1b型(9例)RNA平均滴度为105.28±0.28拷贝/ml.结论定性和定量检测结果有极佳的一致性,酒精依赖丙肝基因型1a和1b血清中HCV含量无显著性差异.
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无偿献血者HCV核心区氨基酸置换情况分析
目的 研究感染HCV的无症状献血者基因型和1b基因型的核心区氨基酸置换情况.方法 用巢式PCR方法扩增91个HCV RNA阳性献血者标本,根据直接测序得到的序列用Mega6.0软件进行序列比对和进化树构建,分析基因型和氨基酸置换情况.结果 在78个测序结果清晰的样品中,66个为基因型1b(84.6％),其他基因型为1a(1,1.3％)、2a(7,8.9％)、3b(2,2.6％)和6a(2,2.6％).62个1b样品的核心区蛋白(aa68-120)发生17处氨基酸置换.第70位R70Q、R70P和R70H各1例;第91位L91M置换非常普遍,为87.9％.结论 本研究中献血者感染的HCV基因型主要为1型,尤其是1b为优势基因型.首次发现中国献血者感染的HCV核心区蛋白的氨基酸置换具有独特性.
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深度测序法在检测HCV不同基因型/亚型混合感染中的应用
目的 将深度测序法用于HCV感染者中不同基因型/亚型混合感染的检测.方法 2例HCV RNA阳性血浆标本(标记为1和2号标本),以NS5B.和E1编码区为目的基因,经RT-PCR扩增后做sanger核苷酸序列测定,对其做基因分型发现2个编码区的分型结果后,重复3次NS5B基因PCR扩增;合并3次PCR产物用Ion TorrentTM半导体测序仪做深度测序.获得的序列用Geneious软件的“The map to reference algorithm”和“De novo assembly”2种方法做序列分析和比对,并用Mega 5构建进化树.结果 sanger测序:1、2号标本NS5B基因分型均为1b,E1基因分型均为2a;深度测序:2个标本均为HCV1b与2a混合感染,其中The map to reference algorithm(Geneious)方法显示,1号标本中1b占92.7％、2a占3.8％、没有比对到的序列(unused seq)占3.5％,2号标本相应为84.3％、5.4％,没有比对到的序列占10.3％;De novo assembly(Geneious)方法显示,1号标本中1b占96.3％、2a占3.7％,2号标本相应为94.1％、5.9％.结论 深度测序技术可以精确地获得HCV混合感染的不同基因型/亚型信息,De novo assembly(Ge-neious)分析HCV的深度测序数据更为精确和直观.
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丙型肝炎病毒耐受干扰素的分子机制研究进展
丙型肝炎(以下简称丙肝)病毒(hepatitis C virus,HCV)是黄病毒科中噬肝病毒属的唯一成员,为单股正链RNA病毒,据世界卫生组织(WHO)统计,2000年全球已有＞1.7亿人感染此类病毒,约占世界人口总数的3％,并且每年约有300万-400万的新发病例[1].HCV感染是慢性肝病(包括肝硬化、肝衰竭和肝细胞癌)的首要病因[2],而面对HCV感染至今并没有行之有效的疫苗.聚乙二醇干扰素-α(PegIFN-α)联合利巴韦林(RBV)是目前治疗慢性丙肝的标准治疗法(SOC),但该疗法对HCV-1型的有效率＜50％,而HCV-1型是美洲国家主要的HCV感染类型,除此之外,Peg IFN-α和RBV有一些严重的副作用[3].影响IFN-α治疗HCV有效性的因素包括病毒因素(RNA聚合酶缺乏校对功能、HCV基因型、病毒基线载量和HCV突变)及宿主因素(肝脏基因表达谱、宿主IL28B基因多态性和肝脏脂肪变性等).现将国内外有关HCV耐受干扰IFN的分子机制研究的新进展综述如下.
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云南和山西无偿献血人群HCV部分基因的核苷酸序列测定及基因分型
目的 了解云南和山西2地无偿献血人群丙型肝炎病毒(HCV)的基因型分布及其差异.方法 采用荧光定量PCR(Q-PCR),对所收集的203份ELISA检测抗-HCV阳性的无偿献血者标本(云南102份,山西101份)做核酸检测,对核酸阳性的标本做E1基因扩增和测序;E1基因阴性者,进一步做NS5B基因扩增;采用DNASTAR、Bi-oedit和Mega4等软件对E1、NS5B基因进行分析及分子进化研究.结果 203份ELISA检测抗-HCV阳性的无偿献血者标本中,云南102份标本经O-PCR检测出核酸阳性55份,从中扩增出E1基因43份,补做NS5B基因扩增获得阳性结果8份;山西省101份标本经O-PCR检测出阳性46份,从中扩增出E1基因33份,补做NS5B基因扩增获得阳性结果6份.云南省献血者HCV基因型(亚型)可分为7种:16[7.84%(4/51)]、2a[13.73%(7/51)]、3a [17.65%(9/51)]、3b[41.18%(21/51)]、6a[7.84%(4/51)]、6n[9.80%(5/51)]和6v[1.96%(1/51)];山西省献血者HCV基因型(亚型)较简单,可分为3种:1b[89.74%(35/39)]、2a[7.69%(3/39)]和3b[2.56%(1/39)].结论 我国云南和山西2地无偿献血人群中的HCV基因型(亚型)的分布存在明显的差异.
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不同基因型丙型肝炎病毒RNA定量分析
目的根据定量PCR检测结果,了解血清不同基因型HCV-RNA的含量. 方法采用荧光定量PCR和逆转录巢式定性PCR同时检测166例丙肝患者的血清HCV-RNA,再进行酶切分型. 计算各型HCV-RNA平均含量. 结果定量PCR阳性血清(131例)HCV-RNA含量在1×104.04～1×108.11拷贝*mL-1. HCV-Ⅱ型(106例)、HCV-Ⅲ型(18例)和Ⅱ/Ⅲ混合型(3例)RNA平均滴度分别为1×106.88±2.01拷贝*mL-1,1×105.79±1.82拷贝*mL-1和105.50±1.62拷贝*mL-1. 结论定性和定量检测结果有很好的一致性. HCV-Ⅱ型病毒含量显著高于HCV-Ⅲ型.
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宿主IL28B基因型联合病毒基因型对慢性丙型肝炎抗病毒疗效的预测
目的 综合分析宿主IL28B基因型和丙型肝炎病毒(HCV)基因型对慢性丙型肝炎患者聚乙二醇干扰素联合利巴韦林抗病毒治疗疗效的影响.方法 对120例慢性丙型肝炎患者进行全程联合治疗.其中92例患者完成了治疗后24周随访,同时分析HCV基因型及宿主IL28B基因型对治疗结束时应答(ETR)及持续病毒学应答(SVR)的影响.结果 IL28B基因CC型在这组慢性丙型肝炎患者中占89％.在HCV基因1b型患者中,IL28B基因CC型患者可以获得比非CC (N CC)型更高的ETR率(P=0.001 4)和SVR率(P=0.000 7),但在HCV基因非1b (N-1b)型患者中,CC型与N-CC型患者间的抗病毒疗效差异无统计学意义；在IL28B基因N-CC型患者中,HCV基因N-1b可以获得比1b型更高的ETR率(P=0.035 0)和SVR率(P=0.022 2),但在CC型患者中,HCV基因N-1b与1b型间的疗效差异无统计学意义.结论 HCV基因型及宿主IL28B基因型对我国慢性丙型肝炎患者聚乙二醇干扰素联合利巴韦林抗病毒治疗疗效具有重要影响.联合检测宿主IL28B基因型和病毒基因型可以更加科学、准确地预测抗病毒疗效,为真正实现个体化治疗提供依据.
关键词： 丙型肝炎病毒(HCV) HCV基因型 IL28B基因型 抗病毒治疗
