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福尔马林固定石蜡包埋组织的PCR-STR分型
分析福尔马林固定石蜡包埋组织的DNA多态性,对某些医疗纠纷或陈年旧案的解决或侦破具有重要作用.本文作者用Promega公司提供的GeneprintSTR system复合扩增试剂盒,检测了1~20年的福尔马林固定石蜡包埋的同一个体不同组织块的DNA,取得满意的效果,现报道如下.
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福尔马林固定组织血型检验1例
目前,国内外有关福尔马林固定或石蜡包埋组织ABO血型及酶型检验方法的报道不多,尚无成熟的经验,笔者在办案工作中遇到这样一个案例,经检验获得了理想的结果,并以此结果为依据一举破案,现报道如下.
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福尔马林固定石蜡包埋组织中DNA提取
由于甲醛介导的DNA损伤和石蜡对DNA提取的阻碍作用,使得常规DNA提取方法很难从福尔马林固定石蜡包埋组织(FFPET)中获取高质量的DNA.近年来,众多学者的研究表明,通过改良预处理方法,优化蛋白酶K消化作用,简化DNA提取步骤,纯化DNA提取物等,可以有效提高FFPET中提取的DNA质量,为FFPET的DNA分析奠定了基础.
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二代测序技术在儿童T淋巴母细胞淋巴瘤全外显子测序中的应用
目的 建立从石蜡包埋的儿童T淋巴母细胞淋巴瘤(T-LBL)病理组织中提取基因组DNA,采用二代测序技术行全外显子测序检测的方法并分析其可行性.方法 从10例儿童T-LBL石蜡包埋组织中提取基因组DNA,PCR反应扩增后采用二代测序技术行全外显子测序检测并确定致病位点,所获得的致病突变采用Sanger测序法测序确认,比较两种方法的一致性.结果 10例石蜡包埋T-LBL组织标本中均成功提取到基因组DNA,采用二代测序技术开展全外显子测序测序均检测到致病突变;二代测序检测结果经Sanger测序法验证,证实致病突变确实存在,且与Sanger测序结果一致.结论 基于二代测序技术的全外显子测序测序可用于检测石蜡包埋的儿童T-LBL病理标本的致病突变.
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石蜡包埋淋巴组织中DNA提取方法的比较
目的:通过比较三种从石蜡组织中提取DNA的不同方法,寻找一种高效、经济而简便的方法指导实际工作。方法选取结外淋巴组织增生性病变8例,采取三种方法提取DNA,分别是酚-氯仿提纯法,快速法和试剂盒法。通过检测提取DNA的浓度和纯度,PCR扩增效果,比较三种DNA提取方法的优劣。结果试剂盒法提取DNA OD260/280比值在1.91-1.96间;酚-氯仿提纯法OD值在1.32-1.68间;快速法OD值在1.19-1.36间。其中试剂盒提取DNA为稳定。3种方法提取的DNA为模板行PCR扩增,阳性率无统计学意义。结论快速法简单、无毒、需要的样品少,是一种值得推荐的DNA提取方法。