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人乳头瘤病毒11型L1主要衣壳蛋白的B细胞表位多肽作为疫苗的研究
分析了人乳头瘤病毒11型(HPV11)L1主要衣壳蛋白的B细胞优势表位,并以此为基础研制表位多肽疫苗.研究中采用Goldkey和PC/Gene软件系统,分析HPV11的L1主要衣壳蛋白的二级结构、抗原性、B细胞表位,并引入氨基酸抗原性指数,综合评估其B细胞优势表位.Fmoc固相合成表位多肽,高效液相层析方法纯化,毛细管电泳分析其纯度.与0.2ml佐剂完全乳化后,按50趣/只的剂量免疫小鼠,进行动物水平的免疫效果评价.取免疫小鼠血清,与HPV11 DNA阳性的尖锐湿疣患者的疣体上清液结合,鉴定免疫后小鼠所产生抗体的特异性.发现HPV11的L1主要衣壳蛋白的第426～439位和第487～501位具有较高的免疫原性,可明显诱导小鼠血清抗体滴度升高,且该抗体与人尖锐湿疣的疣体组织上清液呈阳性反应.说明所选这两个肽段为HPV11的L1主要衣壳蛋白的B细胞优势表位,但是否具有功能特异性,尚需进一步研究.
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HIV-1辅助蛋白Vpr多肽抗体的制备与鉴定
预测Vpr蛋白的B细胞抗原表位,并利用合成的B细胞表位肽制备Vpr特异性抗体.应用生物信息学技术获得Vpr蛋白共享氨基酸序列并预测其潜在B细胞抗原表位,与载体蛋白血蓝蛋白(KLH)偶联合成多肽并免疫家兔,鉴定及纯化获得的多肽特异性抗体.软件预测显示,Vpr蛋白N端的第3～19位(N)和C端的第82～95位(C)氨基酸序列为潜在B细胞抗原表位;ELISA检测抗血清中多肽特异性抗体的效价都达到1∶105以上;Western-Blotting结果显示,无论对HIV-1 B亚型还是CRF07_BC重组型的Vpr蛋白,其多肽N抗体和C抗体均能特异性识别;免疫沉淀结果显示,Vpr多肽N和C抗体也能特异性结合未变性的野生型Vpr或GFP -Vpr融合蛋白.利用生物信息学技术能成功预测Vpr蛋白B细胞抗原表位,免疫所获得的抗体具有较好的特异性和应用性.
关键词： HIV-1辅助蛋白Vpr B细胞表位 表位预测 多肽抗体 -
Ⅰ～Ⅳ型登革病毒包膜蛋白B细胞中和表位的鉴定
登革病毒包膜蛋白(Dengue virus envelope protein,DENV E)是诱导中和抗体主要的蛋白,登革病毒包膜蛋白Ⅲ区(Dengue virus envelope protein domainⅢ,DENV EDⅢ)是构建DENV亚单位疫苗的主要靶标,但是其B细胞中和表位目前了解不多.我们采用两组覆盖DENV-1EDⅢ的重叠多肽(12肽和16肽)同27株针对DENV-1EDⅢ中和单抗反应,筛选DENV EDⅢ上B细胞表位.采用该方法,我们发现了一高度保守的Ⅰ～Ⅳ型DENV共同交叉中和B细胞表位和一高度保守的DENV-1血清型特异性B细胞中和表位,分别位于DENV-1 E蛋白氨基酸残基序列第309～320位和第381～392位(Amino acid residues 309～320,and 381～392;aa 309～320和381～392).Ⅰ～Ⅳ型DENV共同交叉中和B细胞表位在Ⅰ～ Ⅳ型DENV分离株中存在高度保守共同序列310KE-VAETQHGT"9,DENV-1E蛋白中E309、V312、A313和V320不影响蛋白抗原性.DENV-1血清型特异性B细胞中和表位(DENV-1 E蛋白氨aa 381～392)在DENV-1分离株中高度保守,在黄病毒属其它病毒中不保守.我们也发现一具有DENV-1分离株特异性的B细胞中和表位位于DENV-1 E蛋白氨基酸残基序列第329～348位.这些新发现的DENV-1 E蛋白EDⅢ上B细胞中和表位可能有助于研制新的DENV亚单位疫苗.
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淋病奈瑟菌外膜蛋白PorB二级结构及其B细胞和T细胞表位分析
目的 分析淋病奈瑟菌外膜蛋白PorB的二级结构及其潜在的优势B细胞和T细胞抗原表位. 方法 应用在线工具TMHMM对PorB全长氨基酸序列进行跨膜区域分析,利用EXPASY服务器上的GOR4和SOPMA工具预测PorB的二级结构,通过DNAStar软件Protean模块的Karplus-Schulz、Kyte-Doolittle、Emini方法和Jameson-Wolf方法分析PorB蛋白的柔韧性、亲水性、表面可及性和抗原性,以综合预测其优势B细胞表位.选择常见的HLA基因型,并兼顾小鼠H2-Ed、Ek限制性,利用SYFPEITHI软件以多肽氨基酸是否为锚定残基、辅助残基或优势残基进行记分,选择得分高的肽段作为候选T细胞表位,采用NetMHC-Ⅱ软件以肽段分子与MHC分子的亲和力为依据,判断肽段的抗原性,综合SYFPEITHI和NetMHC-Ⅱ软件分析结果以确定T细胞抗原表位存在的可能区域. 结果 PorB蛋白的N端第1-20氨基酸为跨膜区,第20以后的氨基酸则位于膜外;PorB的二级结构以无规则卷曲为主,亦可见α螺旋和β折叠;根据其柔韧性、亲水性、表面可及性和抗原性特征综合分析,PorB优势B细胞表位可能存在于氨基酸序列N端的第165-175,195-206,236-243,275-282肽段;SYFPEITHI和NetMHC-Ⅱ软件预测出T细胞优势表位可能位于第18-32、126-142和186-200肽段. 结论 应用生物信息学方法分析PorB蛋白的T细胞和B细胞优势表位可能分别是第18-32、126-142和186-200肽段,165-175,195-206,236-243,275-282肽段,为淋球菌表位疫苗的研制提供了思路和理论依据.
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人乳头瘤病毒58型L1蛋白B细胞表位预测和分析
目的 对人乳头瘤病毒58型(HPV58)主要结构蛋白(L1)的B细胞表位进行预测和分析. 方法 利用生物信息学软件EXPASY在线分析HPV58型L1蛋白的二级结构及生物学特性,包括跨膜趋势、表面可及性、抗原性、亲水性,溶性等,从而对其B细胞表位进行综合分析和预测. 结果 通过亲水性参数,Zimmcrman极性,柔韧性参数,表面可及性及抗原性进行综合分析,预测人乳头瘤病毒58型L1蛋白的B细胞表位可能位于其N端的29-37,43,46-58,64-67,74,79-88,93,100-101,103-125,133-139,149,151-180,187-213,220-213,235,238-247,252-271,277-282,286-309,320-323,327-338,341-348,351,353-368,373-396,408,427,419-425,433-444,453-468,470,475-486,488-490,493-494,497-524肽段区域;进一步用Protien Plast在线同源匹配分析,79-88、190-216、373-396、453-468、497-524肽段区段为可能的B细胞表位. 结论 用多参数预测分析HPV58型L1蛋白可能的B细胞表位,为进一步研究高危型58型L1蛋白的生物学特性提供了理论基础.
关键词： 人乳头瘤病毒58型(HPV58) B细胞表位 L1蛋白 同源性匹配分析 -
5种高危型HPVE7蛋白B细胞表位的预测
目的 预测并分析我国人群常见人乳头瘤病毒HPV16、18、33、52与58亚型E7蛋白的线性B细胞表位.方法 在NCBI数据库中获取5种高危型HPVE7蛋白氨基酸序列,采用ClustalX2软件进行多序列比对;运用ExPASY服务器SOPMA和GOR4法预测二级结构,采用Kyte-Doolittle方案和Hopp-Wood方案预测亲水性;运用Bepipred和ABCpred软件预测B细胞表位,辅以抗原性指数,综合评判几率较大的B细胞优势表位. 结果 综合多参数分析,5种HPV亚型的B细胞表位均集中在蛋白质的N端2-50位附近,其中预测的HPV16与52亚型的第16-21位氨基酸序列一致性为100％,均为QPETTD;HPV16型第28-41位(LNDSSEEEDEIDGP)与HPV52型第28-38位(LGDSS-DEEDTD)的氨基酸序列一致性为78％;HPV16型第42-50位(AGQADEPRA),HPV33型第31-46位(SSDEDE-GLDRP),HPV52型第36-46位(DTDGVDRPDGQ)和HPV58型第73-78位(TTTDVR)为各自的特异B细胞表位.结论 生物信息学方法预测5种HPV的B细胞表位均集中在蛋白质的N端2-50位附近,同时具有特异的B细胞表位(18型除外),可为宫颈癌的诊断、预防和新型疫苗的研制提供参考.
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TH线性肽对人肝素酶B细胞表位多抗原肽的免疫增强作用
目的 探讨提高人肝素酶B细胞表位肽应答效应的免疫策略.方法 预测人肝素酶蛋白B细胞表位,采用8分支多抗原肽(MAP)结构合成多肽,利用ELISA鉴定合成的MAP与肝素酶全蛋白抗体的结合反应.以MAP联合或不联合通用型TH表位线性肽免疫C57BL/6小鼠,动态检测免疫血清效价.结果 软件预测得到3个肝素酶蛋白B细胞表位,即大亚基的第1～15位(MAP1)、第279～293位(MAP2)及175～189位(MAP3)氨基酸序列.ELISA显示,MAP2多肽与全蛋白抗体的结合力明显强于MAP1及MAP3,MAP与TH线性肽联合免疫产生的抗体滴度明显高于单纯MAP免疫组.结论 生物信息学预测得到的3个表位肽均为肝素酶蛋白的B细胞优势表位,T辅助表位线性肽能显著增强MAP的免疫效应.
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嵌合的βhCG-CTP免疫原性的研究
目的 通过分子改进提高βhCG-CTP避孕疫苗的免疫原性.方法 根据分子设计及免疫识别原理,利用蛋白质固相合成技术人工合成一小分子表位嵌合多肽,内含βhCG-CTP上的两个B细胞表位(β8、β9)以及一个源自麻疹病毒融合蛋白的T细胞表位,以此多肽免疫家兔,以WHO的βhCG-CTP疫苗标准品为对照,用ELISA测定所产生的抗体滴度,比较两者的免疫原性.结果 该嵌合多肽免疫家兔后产生的抗体滴度显著高于WHO βhCG-CTP疫苗标准品,且能与天然hCG结合.结论 人工合成的表位嵌合多肽免疫原性较βhCG-CTP明显提高,而多肽分子的抗原性未受影响,免疫家兔后诱生的抗体与天然hCG结合力强,引入T细胞表位能提高小分子多肽的免疫原性,表明通过分子改进可提高避孕疫苗的免疫原性.
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人类肝素酶B细胞表位的预测和免疫原性鉴定
目的 预测并鉴定肝素酶(heparanase)蛋白B细胞表位免疫原性.方法 以肝素酶蛋白的氨基酸序列为基础,采用DNAStar分析软件以及Bcepred在线二级结构分析工具分析其蛋白二级结构并预测B细胞表位.根据预测结果 ,采用8分支多抗原肽结构合成针对该表位的抗原肽,将后者与通用型T辅助表位人IL-1β线性短肽(VQGEESNDK,氨基酸163～171)联合免疫日本白毛黑眼兔,检测免疫血清效价,鉴定其特异性和免疫原性.结果 软件预测显示,肝素酶蛋白大亚基的第1～15位(MAP1)、第279～293位(MAP2)及175～189位(MAP3)氨基酸序列可能为其优势B细胞表位.间接酶联免疫吸附试验、免疫印迹及免疫组化分析,证实MAP1、MAP2及MAP3均能诱导机体产生高滴度抗体,但仅MAP1、MAP2抗体具有高特异性,MAP2抗体与肝癌组织的结合力强.结论 肝素酶大亚基的第1～15位、第279～293位氨基酸为其优势B细胞表位,其中第279～293位氨基酸的免疫原性强,这为肝素酶多肽抗体及B细胞优势短肽疫苗研制提供了理论依据.
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幽门螺杆菌UreB抗原表位预测及其有效表位噬菌体展示的筛选
目的 筛选幽门螺杆菌(Hp)尿素酶B亚单位(UreB)分子中的抗原表位,为研制多抗原肽(MAP)疫苗奠定基础.方法 采用生物信息学技术对UreB的T细胞和B细胞表位进行预测和分析.构建ureB基因原核表达系统,Ni-NTA亲和层析法提纯目的重组表达产物rUreB,常规皮内免疫法制备兔抗血清.选择UreB主要T细胞和B细胞联合表位肽并构建其噬菌体展示系统,PEG/NaCl沉淀法提纯重组噬菌体,SDS-PAGE鉴定目的重组PⅢ蛋白(rPⅢ).分别以商品化抗Hp全菌IgG和rUreB抗血清为一抗,采用Western blot对上述表位肽进行鉴定和筛选.结果 与GenBank中相关序列比较,所克隆的ureB基因核苷酸和氨基酸相似性分别为96%～99.5%和96%～100%.rUreB表达量约为细菌总蛋白的52%,提纯后仅见单一蛋白条带.预测的4个主要表位肽UreB230、UreB322、UreB479和UreB527在M13噬菌体中获得成功表达,采用不同一抗的Western blot均显示相似的阳性结果,但UreB322和UreB527反应强度明显高于UreB230和UreB479.结论 本研究成功地构建ureB基因高效原核表达系统和UreB主要T细胞和B细胞联合表位肽噬菌体展示系统.所采用的生物信息学技术可有效地预测抗原表位.UreB322和UreB527是UreB有效抗原表位,可作为幽门螺杆菌MAP疫苗的候选表位.
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人偏肺病毒黏附蛋白的二级结构及B细胞表位初步预测
目的预测人偏肺病毒G蛋白的二级结构及B细胞表位.方法分别采用SOPMA方法及HMMTOP程序预测G蛋白的二级结构和跨膜区域;综合分析蛋白的柔性结构、亲水性、表面可及性与抗原性指数,预测G蛋白的抗原表位.结果G蛋白的二级结构主要为柔性区域,占62.1%;α-螺旋占22.37%;β-折叠占15.53%;N端第32～51位氨基酸残基为跨膜区.B细胞表位位于G蛋白N端55～77、80～104、111～126、130～167、178～210区段.结论应用多参数预测G蛋白的二级结构与B细胞表位,为进一步研究蛋白特征、单克隆抗体制备及表位疫苗研制奠定了基础.
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多型别HCV-E1复合表位抗原研究
目的 设计多型别HCV-E1表位复合免疫原,通过免疫小鼠,探讨其在丙型肝炎治疗性疫苗与诊断试剂研究中的应用.方法 分析比较HCV-E1包膜糖蛋白B细胞表位序列,选取几个代表性基因型的中和性优势抗原表位,再结合泛DR辅助性T细胞表位(PADRE),构建含有不同HCV型别E1表位抗原基因和通用T辅助细胞表位基因的原核表达质粒.结果 成功构建了含有HCV 1a、1b、2a、3a、4a和6a等基因型E1中和性表位以及通用T辅助细胞表位的质粒pBVIL1/E1s-PADRE,该质粒转化大肠杆菌后获得的工程菌,通过诱导培养可以高效表达重组多型别HCV-E1表位复合抗原,所获得的多型别HCV-E1表位复合免疫原可在BALB/c小鼠体内诱发强烈的体液免疫反应,ELISA检测抗体水平可达到1:12 800.结论 新构建的HCV-E1表位复合免疫原具有很好的免疫原性,为进一步研究HCV疫苗奠定了基础.
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日本血吸虫钙蛋白酶肽链文库的制备及其B细胞表位的筛选
目的筛选钙蛋白酶(calpain)的B细胞表位,探讨其B细胞表位的免疫原性及其所诱导的免疫应答类型. 方法用Genetyx-MAC9.0分析calpain肽连的亲水性,在亲水性区域以9个氨基酸为肽链单位的固相重叠肽链库(每相邻两个肽链之间仅有一个氨基酸不同)被Auto-spot Robot制备,用Dot-ELISA在合成的肽链库上筛选B细胞表位,含有B细胞表位的肽链免疫BALB/c小鼠, ELISA鉴别特异性IgG抗体亚类的产生. 结果由758个氨基酸组成的日本血吸虫calpain蛋白含有2个主要的亲水区,其存在区域分别在氨基酸229～375和555～613;当我们测定合成的肽链文库时,在亲水区内筛选出4个B细胞的表位,分别是氨基酸234～251(YAHLSGGT);290～297(CLMGCSIH);338～346(PWGDSHEW);358～364(AWCDGAPQ);与对照组鼠相比较免疫鼠血清中IgG1、IgG2a、IgG2b特异性抗体有显著性意义的上升. 结论日本血吸虫calpain是一个具有免疫原性的蛋白,能够激发宿主产生高水平的免疫球蛋白,提示calpain的B细胞表位可以成为日本血吸虫病的诊断抗原和日本血吸虫疫苗候选分子.
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统计学筛选电脑预测的人H5N1毒株核蛋白B细胞表位
目的 预测并筛选人禽流感H5N1毒株核蛋白(NP)的B细胞抗原表位.方法 采用DNAStar Lasergene 7.1软件,进行人禽流感H5N1毒株NP基因核苷酸序列分析.采用Kyte-Doolittle的亲水性方法、Emini方法和Jameson-Wolf抗原指数方法,辅以对NP的二级结构中的柔性区域的分析,采用SPSS13.0进行聚类、相关和四分位数分析,建立一种统计学筛选程序,预测H5N1病毒NP的B细胞表位,并对毒株A/GD/01/06(H5N1)的NP变异进行评价.结果 预测并筛选有可能的B细胞表位为位于NP的N端317～326、452～457、467～473、367～370、491～498、375～378、171～177、48～53、245～250、76～104肽段等.A/GD/01/06(H5N1)的NP通过氨基酸第370位(N370S)位点置换,增加一个糖基化位点(NES368-370)并改变NP的特性.结论 用多参数预测并统计学筛选H5N1毒株NP的B细胞表位,可以为分子免疫学研究和药物筛选提供依据.A/GD/01/06(H5N1)毒株NP氨基酸第370位(N370S)位点置换改变其抗原性,但抗原表位大小未变(SNEN367-370).
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幽门螺杆菌黏附素A有效T和B联合抗原表位噬菌体展示和抗原性测定
目的 分析并确定幽门螺杆菌黏附素A(HpaA)分子中有效T细胞和B细胞联合(T/B)抗原表位.方法 重组表达HpaA(rHpaA)并免疫家兔制备抗血清.采用生物信息学技术预测和分析HpaA分子中T细胞和B细胞表位,PCB扩增T/B联合表位肽片段并构建其噬菌体展示系统.采用PEG/NaCl沉淀法提纯展示了T/B联合表位的重组噬菌体PⅢ蛋白(rPⅢ).分别以商品化幽门螺杆菌全菌IgG抗体和rHpaA抗血清为一抗,采用Western blot和ELISA对rPⅢ蛋白中展示的T/B联合表位进行筛选和鉴定.采用MTT检测rHpaA免疫小鼠脾细胞在不同重组噬菌体蛋白刺激下的增殖情况.结果 HpaA分子中共有5个T/B联合表位:HpaA10、HpaA37、HpaA79、HpaA116和HpaA143.所有T/B联合表位均成功地展示于M13噬菌体PⅢ蛋白表面.Western blot、ELISA和淋巴细胞增殖试验结果 均显示,HpaA116是优势抗原表位,HpaA37和HpaA79为有效抗原表位,HpaA10和HpaA143为无效抗原表位.结论 本研究成功地构建了幽门螺杆菌HpaA的T/B联合表位肽噬菌体展示系统.HpaA37和HpaA79,尤其是HpaA116是HpaA有效T/B联合抗原表位.
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广州地区人巨细胞病毒临床低传代病毒株UL136基因B细胞表位的多参数预测分析
目的 多参数预测广州地区人巨细胞病毒(HCMV)临床低传代病毒株UL136基因B细胞表位.方法 应用改进型自我优化预测结构(SOPMA),Garnier-Osguthorpe-Robson(GOR),人工神经网络预测法(HNN)预测二级结构;应用隐马尔可夫模型(TMHMM)预测跨膜结构;应用Hopp&Woods亲水性方案、Emini可及性方案、Jameson-Wolf抗原性方案等参数综合预测UL136基因B细胞表位.结果 HCMV UL136氨基酸包含240个氨基酸残基,相对分子质量约为27.3 kD,等电点为8.26.TMHMM预测UL136存在一个跨膜区域,为65~87aa区域,胞外区域为88~240aa区域.多参数预测显示:亲水性位于18~29、46~61、94~100、110~144、152~169、171~186、190~202、229~236aa区域;表面可及性位于19~26、49~61、89~97、110~127、161~167、173~182、196~202、229~234aa区域;极性位于18~29、31~36、51~59、94~102、111~130、155~163、178~182aa区域;柔韧性位于18~28、46~60、115~142、148~156、160~205、226~236aa区域;抗原性位于4~9、16~32、45~62、92~101、106~144、150~157、160~206、228~240aa区域.二级结构预测显示:以α-螺旋为主,无规则卷及β-转角区域主要位于5~10、45~61、108~113、129~139、163~182、187~192、195~204、229~234aa区域.ABCpred服务器综合分析显示:45~60、194~209、6~21、186~201、116~131、54~69、151~166、122~137、223~238aa区域分值较高.抗原指数(AI)预测显示:115~130、196~204、163~182、229~234aa区域AI较高.结论 HCMV UL136基因B细胞表位可能位于115~130、196~204、229~234aa区域内或其附近区域,预测UL136 B细胞表位为HCMV的治疗提供了实验依据.
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人巨细胞病毒临床低传代病毒株D2的UL140基因B细胞表位生物信息学特征
目的 探讨广东省妇幼保健院分离鉴定的人巨细胞病毒(HCM V)临床低传代病毒株D2(以下简称为HCMV D2)的UL140基因B细胞表位的生物信息学特征.方法 采用2016年3月至2017年3月,于广东省妇幼保健院新生儿科确诊感染HCM V的10例新生儿新鲜尿液标本中,分离鉴定的HCMV D2为研究材料.采用生物信息学方法,包括隐马尔可夫模型(TMHMM)预测HCMV D2 UL140基因跨膜结构,ExPASy在线序列分析平台预测基因的亲水性、表面可及性、极性、柔韧性及抗原性参数,以及GOR(Garnier-Osguthorpe-Robson)、人工神经网络预测法(HNN)、改进型自我优化预测结构(SOPMA)预测UL140基因二级结构.综合分析上述预测结果 ,并计算UL140基因的氨基酸残基抗原指数(AI),总结UL140基因B细胞表位的生物信息学特征.结果来自广东省妇幼保健院感染HCMV新生儿的HCMV D2 UL140基因的氨基酸包含191个氨基酸残基,相对分子质量为21.5×103,等电点为5.12.UL140基因B细胞表位的生物信息学特征包括:①TMHMM预测UL140基因存在1个跨膜区域,为26-48aa,细胞外区域为1-25aa.②ExPASy在线序列分析平台预测UL140基因的亲水性位于14-22、66-72、76-95、113-125、136-148、55-160、167-176aa;表面可及性位于5-22、50-60、64-96、132-160、167-187aa;极性位于5-22、45-98、103-128、132-187aa;柔韧性位于16-26、75-100、104-113、136-160aa;抗原性位于9-18、53-58、82-88、115-124、136-146、164-187aa.③U L140基因二级结构预测结果为,无规则卷及 β-转角主要位于1-8、13-25、79-95、103-113、153-159aa.④计算UL140基因氨基酸残基的AI较高区域的结果显示,5-10、14-22aa区域的AI较高.结论 HCMV D2 UL140基因B细胞表位,可能位于的区域为5-10、14-22aa或其附近.
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人巨细胞病毒临床病毒株UL148基因B细胞表位的预测与分析
目的 预测与分析人巨细胞病毒(HCMV)临床病毒株UL148基因B细胞表位.方法 应用生物信息学方法,以HCMV UL148基因氨基酸序列为基础,采用改进型自我优化预测结构(SOPMA),Garnier-Osguthorpe-Robson (GOR),人工神经网络预测法(HNN)预测二级结构,结合跨膜结构、Hopp＆Woods亲水性方案、Emini可及性方案、Jameson-Wolf抗原性方案等参数综合预测UL148基因B细胞表位.结果 HCMV pUL148氨基酸包含316个氨基酸残基,相对分子质量为36 kD,等电点为9.15;应用SOPMA,GOR,HNN方案预测pUL148二级结构,均显示以α-螺旋为主,无规则卷及β-转角区域多位于14～21,98～106,132～139,174～181,191～197,267～272,235～240.TMHMM预测pUL148存在一个跨膜区域,为286～308位氨基酸,胞外区域为1～285位氨基酸.结论 HCMV UL148基因265～275,221～229,18～25位氨基酸序列区域内或其附近主要以无规则卷或β-转角结构为主,且抗原指数(AI)较高,极有可能是B细胞表位.
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人巨细胞病毒包膜糖蛋白B线性B细胞抗原表位的预测
目的：通过生物信息学方法分析人巨细胞病毒（ human cytomegalovirus ，HCMV）包膜糖蛋白B （ glycopro－tein B，gB）的结构及理化特性，预测gB的线性B细胞抗原表位。方法基于HCMV gB的序列，利用两种在线B细胞表位预测程序及DNAstar软件对gB进行预测；利用SWISS－MODEL服务器同源构建gB三级结构模型，进行进一步验证。结果与结论综合多项分析，预测得到HCMVgB的多个线性B细胞表位，为后续验证其优势中和表位，建立富含高效价中和抗体的原料血浆的筛选方法奠定了基础。
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