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长散在核元件LINE1与细胞衰老
DNA损伤是细胞衰老的共同通路,在DNA损伤过程中,长散在核元件LINE1发挥着重要的作用。LINE1一方面通过逆转录转座使遗传信息能够在胞质和胞核之间传递,使生物得以不断进化,另一方面转座过程中造成的DNA损伤,随时间累积可引起基因改变,造成细胞衰老及各种遗传性疾病。
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ORF1编码的四种非结构蛋白可用于戊型肝炎病毒的基因分型
目的 探讨人类戊型肝炎病毒(HEV)开放阅读框(ORF)1编码的四种非结构蛋白的基因序列能否用于其基因组的分型.方法 从GenBank中查找并下载能感染人类测序完整的全基因组的HEV基因组及蛋白序列共35株,用Clustal W程序对35株HEV的ORF1编码区序列进行多序列比对,并用treev32绘制基因进化树,研究其进化关系.结果 HEV的基因组全长为7.5kb;而RNA依赖的RNA聚合酶只有1460bp,其他的基因序列则更短,木瓜样半胱氨酸蛋白酶为479bp、解旋酶为734bp,多聚脯氨酸铰链只有200bp.这四种蛋白的多序列比对和进化分析结果与GenBank中的分型结果相符.结论 HEV ORF1编码表达的木瓜样半胱氨酸蛋白酶、多聚脯氨酸铰链、解旋酶和RNA依赖的RNA聚合酶的基因序列更短,且可作为HEV的分型依据,从而为HEV的分型找到了一种更简便、快捷的方法.