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基于基因影像学方法的肝细胞癌预后影像标记物研究
目的 通过肝细胞癌影像特征和基因模块关联的基因影像学方法,获取生物可解释的影像学标记物.方法 从癌症基因组数据库获取371例肝细胞癌基因表达数据,其中37例有对应的术前增强CT数据.从勾画的肿瘤区域提取639维定量影像特征,基于一致性指数标准,筛选出12个影像特征.对肝细胞癌基因表达数据进行聚类,得到聚类基因模块,并与影像特征构建Spearman相关图,筛选出与基因模块关联的影像特征,后用Cox回归模型评估其是否具有预后功能.结果 12个影像特征中,4个与预后的基因模块显著相关,3个与生存预后显著相关.其中,小波分量高灰度级小区域增强特征,与代表糖链生物合成的基因模块显著相关,且该影像特征与病人的总体生存周期(P=0.006,风险比=0.16)显著相关;低灰度级长游程增强纹理特征,与代表血管生成的基因模块显著相关,且与总体生存周期(P =0.049,风险比=3.21)显著相关.结论 描述肿瘤小波频率和纹理的影像特征有可解释的生物学含义,并且与生存周期显著相关,这些特征可作为肝细胞癌潜在的影像学标记物.
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FK506结合蛋白5基因rs1360780位点多态性对抑郁症患者脑静息态磁共振局部一致性的影响
目的 探讨FK506结合蛋白5(FK506-binding protein 5,FKBP5)基因rs1360780位点T风险等位基因对抑郁症患者静息态脑功能的影响及与临床症状群、免疫功能的关联.方法 纳入147例抑郁症患者及61例性别、年龄及受教育年限均匹配的正常对照,进行3.0T静息态磁共振扫描、基因分型及外周血清免疫球蛋白和补体浓度测定.计算脑功能局部一致性(regional homogeneity,ReHo),采用双因素方差分析疾病主效应、基因多态性主效应、疾病与基因多态性交互效应下全脑ReHo的差异,并在方差分析的基础上进行事后检验分析抑郁症患者携带与不携带T风险等位基因个体的脑功能特征上的差异,将有差异的脑区与汉密尔顿17项量表总分、5项因子分及外周血清免疫球蛋白、补体进行Pearson相关分析.结果 (1)疾病与基因多态性交互效应的脑区:左侧额下回岛盖部(MNI:x,y,z=-42,6,9;F=10.83)、右侧额下回岛盖部(MNI:x,y,z=30,6,33;F=15.05)、左侧内侧额上回(MNI:x,y,z=-9,54,0;F=9.17)、左侧苍白球(MNI:x,y,z=-12,6,-6;F=11.37)(Alphasim校正后P＜0.05).(2)事后分析比较,基因多态性为主效应下,抑郁症患者携带rs1360780T风险等位基因较不携带者ReHo值升高的脑区为右侧额下回岛盖部(MNI:x,y,z=60,12,6;t=2.88);交互效应下,抑郁症患者携带rs1360780 T风险等位基因较不携带者ReHo值升高的脑区为右侧额下回岛盖部(MNI:x,y,z=30,6,33;t=2.96),ReHo下降的脑区为左侧额下回眶部(MNI:x,y,z=-21,9,-18;t=-3.21)(Alphasim校正后P＜0.05).(3)Pearson相关分析表明,携带rs1360780 T等位基因的抑郁症患者右侧额下回岛盖部脑区的ReHo值与焦虑躯体因子分呈正相关(r=0.421,P＜0.001),与外周血清IgG浓度呈负相关(r=-0.528,P=0.0016),均通过Bonferroni校正.结论 本研究发现携带FKBP5基因rs1360780位点T风险等位基因的抑郁症患者右侧额下回岛盖局部神经元协同性活动异常,这可能是焦虑躯体化症状群及免疫功能异常潜在的神经病理机制之一.
关键词： 抑郁症 FK506结合蛋白5 基因影像学 局部一致性 免疫功能
