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7个VNTRs用于65株中国分离的结核分枝杆菌基因多态性研究
目的应用数目可变串联重复位点(variable number of tandem repeats, VNTRs)分子分型技术,初步探讨我国结核分枝杆菌的基因多态性特征. 方法采用PCR和琼脂糖凝胶电泳技术,对结核分枝杆菌的11个数目可变重复位点进行检测,并应用Gel-Pro analyzer 3.1软件和BioNumerics(Version 3.0)软件进行结果分析,分析结核分枝杆菌DNA多态性特征. 结果选取结核分枝杆菌基因组中的7个(ETR-A、ETR-B、ETR-C、ETR-D、ETR-E、ETR-F、 MPTR-A)具有明显多态性特征的串联重复位点,检测分析了65株来自安徽、湖南和江苏省的结核分枝杆菌,结果显示被测菌株可分为10个不同的基因型,其中以2个型别为主,占总菌株数的69.2%,其他菌株呈散在分布. 结论采用VNTR分型技术初步分析表明,中国结核分枝杆菌具有明显的基因多态性,且存在主要流行菌群.
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VNTR技术用于安徽省耐药结核分支杆菌基因分型的初步研究
目的探讨VNTR(variable number of tandem repeat)技术在安徽省耐药结核分支杆菌基因分型中的应用. 方法初步选取13个分型效果较好的VNTR基因位点.应用聚合酶链反应(PCR)和琼脂糖凝胶电泳,建立检测耐药结核分支杆菌DNA指纹多态性的方法,分析耐药结核分支杆菌DNA多态性. 结果共对78株耐药结核分支杆菌的13个VNTR位点进行了检测,根据这些菌株的指纹多态性特征,共分为4个基因型(Ⅰ型、Ⅱ型、Ⅲ型、Ⅳ型),分别为Ⅰ型3.8%(3/78)、Ⅱ型6.4%(5/78)、Ⅲ型10.3%(8/78)、Ⅳ型所占比例大,为79.5%(62/78).在Ⅳ型菌中,耐药菌株主要为耐多药(结核分支杆菌至少耐异烟肼和利福平两种药)和单耐利福平菌株,其所占比例分别为45.8%和22.6%. 结论本资料分析表明,安徽省耐药结核分支杆菌的传播似以Ⅳ型菌株为主,应加强此型菌株流行的监控.
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5个VNTR位点用于我国三省65株结核分支杆菌菌株基因分型的研究
目的初步探讨我国结核分支杆菌的数目可变串联重复位点(Variable Number of Tandem Repeat,VNTR)的分布特征及其在基因分型中的应用.方法选取结核分支杆菌基因组中的5个VNTR位点,采用PCR和琼脂糖凝胶电泳技术,并应用BioNumerics(Version3.0)软件进行处理,分析结核分支杆菌DNA中VNTR分布多态性.结果检测分析的65株结核分支杆菌具有明显的多态性,共分成12个不同的型别,其中大部分菌株属于一个型,占64.6%,其他菌株呈散在分布.结论我国结核分支杆菌的VNTR具有明显的多态性.VNTR分型技术具有简便、快速、特异、重复性好等优点,可广泛用于结核病的分子流行病学研究.
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应用VNTR技术对吉林省结核分枝杆菌基因分型的研究
目的:探讨VNTR(variable number of tandem repeat)技术在吉林省结核分枝杆菌基因分型中的应用.方法:初步选取15个分型效果较好的VNTR基因位点,采用聚合酶链反应(PCR)和琼脂糖凝胶电泳,并应用BioNumerics(Version3.0)软件进行处理,建立检测结核分枝杆菌DNA指纹多态性的方法,分析耐药结核分枝杆菌的DNA多态性.结果:共对320株结核分枝杆菌的15个VNTR位点进行了检测,根据这些菌株的指纹多态性特征,共分成26个型别,其中大部分属于一个型(Ⅰ型),占82.5%(264/320),其他菌株呈散在分布.结论:资料分析表明,吉林省结核分枝杆菌的传播似以Ⅰ型菌株为主,应加强此型菌株流行的监控.
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应用MLVA技术对吉林省294株结核分枝杆菌分型分析
目的 初步探讨利用VNTR(variable number of tandem repeat)技术对吉林省294株结核分枝杆菌分型的分布特征.方法 采用多位点串联重复序列(MLVA)分型方法初步选取13个分型效果较好的VNTR基因位点,采用聚合酶链反应(PCR)和琼脂糖凝胶电泳,通过BioNumerics(Version3.0)软件进行处理,分析吉林省耐药结核分枝杆菌的DNA多态性.结果 共对294株结核分枝杆菌的13个VNTR位点进行了检测,根据这些菌株的指纹多态性特征,主要分成13个型,其中占据主要的前三型分别为Ⅰ型,占81.6%(240/294),二型占2.1%(6/294),三型占1.7%(5/294),由此可以看出本次实验菌株除Ⅰ型以外,其他菌株基本呈散在分布.结论 分析表明吉林省结核分枝杆菌以Ⅰ型菌株为主,应加强型菌株流行的监控及研究.
