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北京地区收集的人乳头瘤病毒52型基因突变和型下分类的研究
目的 了解国内人乳头瘤病毒(human papillomavirus type,HPV) 52型E7癌基因和长调控区(long control region,LCR)的序列信息,并对其进行型下系(lineage)分类的研究.方法 共收集了1 244例宫颈脱落细胞样品,从中提取DNA并进行HPV DNA分型检测.使用PCR法扩增了其中79例HPV52单独感染样品的E7基因和LCR并进行了序列分析,其中全部测序成功的样本数为50例.分析了该50例样品代表的大陆地区与亚洲其他地区的HPV52型下系分布构成.结果 E7基因和LCR的变异频率分别为92.0％ (46/50)和96.0％ (48/50).E7基因和LCR分别存在5种和14种基因型.测序成功的50例HPV52分离株在型下系分类上,B占90.0％(45/50),A占8.0％ (4/50),C占2.0％ (1/50),没有发现分类为D的样品.亚洲各地区间HPV52的系分布构成比不同.结论 国内的HPV52在E7基因和LCR上存在着高频率的突变.亚洲各地区间HPV52的系分布构成存在地域性.
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人乳头瘤病毒52型E6和E7基因突变与宫颈癌及癌前病变关系的研究
目的 分析人乳头瘤病毒(human papillomavirus,HPV)52型E 6和E 7基因突变位点分布,评估基因突变与宫颈癌及癌前病变的相关性.方法 收集2016年1月至2017年5月经HPV DNA检测为HPV 52单独阳性的DNA样本120例.应用Generunner V 3. 01软件设计扩增E 6/E 7区域的1对PCR引物和Sanger测序的4条延伸引物.以HPV 52原型(GenBank Accession No. X 74481. 1)作为参考序列,应用MEGA 5. 05软件分析每个样本的碱基序列和蛋白序列的变异;应用SPSS 17. 0进行一般线性相关检验和Fisher's 检验或者Pearson Chi-square(χ2)检验,分析E 6和E 7基因突变与宫颈病变的关系.结果 在104例样本中,共发现HPV 52 E 6基因的16个突变位点和E 7基因的17个突变位点. HPV 52 E 6和E 7基因中不同突变位点的突变率差异无统计学意义(χ2=14. 829、12. 548,P=0. 464、0. 766).在HPV 52 E 6和E 7基因的33种突变中,无突变位点的突变率随着宫颈病变等级恶化有升高或降低的趋势(P＞0. 05). HPV 52 E 6基因在CIN 1+样本中的突变频率(14. 0 %)显著低于正常样本中突变频率(34. 4 %),(OR=0. 31,95 % CI=0. 11～0. 85,χ2=5. 500,P=0. 019). E 7 基因的突变频率在CIN 1 +样本中的突变频率(16. 3 %)也低于在正常样本中的突变频率(27. 9 %),但差异无统计学意义(OR=0. 50,95 % CI=0. 19～1. 35, χ2=1. 908, P=0. 167).结论 在单独感染HPV 52的条件下,E 6基因突变是阻碍宫颈病变和宫颈癌发生发展的因素.
