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1983-2013年B型流感病毒的重配研究
目的 研究1983-2013年间B型流感病毒的重配变异情况.方法 对GenBank数据库中1983-2013年间具有8个片段全基因组序列的B型流感病毒进行分析,利用Simplot软件筛选重配病毒,利用MEGA软件进行系统进化分析验证重配病毒.结果 获得432株B型流感病毒的全基因组序列,在66株代表病毒中,共计发现了22株重配株,其中9个为系内重配,13个为系间重配.在9个系内重配病毒中,2个B/Vic-87系内重配,7个B/Yam-88系内重配.Simplot软件结果和MEGA软件验证结果相似.结论 B型流感病毒间的重配事件频繁发生,既存在系内重配,也存在两系间的重配.Simplot软件可以用于快速筛选B型流感重配病毒.
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河北省卢龙地区猪与人G9型A组轮状病毒进化关系研究
目的 了解河北省卢龙地区猪与人G9型A组轮状病毒(GARV)主要基因的分子特征及进化关系.方法 选取1株2008年河北卢龙地区G9型GARV阳性的腹泻仔猪粪便标本LLP48及4株2009年至2011年卢龙地区G9型GARV阳性的5岁以下住院腹泻患儿粪便标本进行主要基因片段的扩增,测序后对获得的基因序列通过MEGA、DNAStar等生物软件进行序列比对、同源性分析和系统进化分析.结果 卢龙猪GARV LLP48与4株卢龙人GARV编码的VP7、VP6、NSP2和NSP4基因具有高度同源性,核苷酸和氨基酸同源性分别是89.4％～94％和94.8％ ～98.2％;VP4片段的核苷酸(氨基酸)同源性较低,为71.4％～71.6％(68.2％～69.0％).系统进化分析表明,LLP48编码的VP7、VP6、NSP2和NSP4基因与人来源的毒株关系密切,而VP4基因与猪来源的毒株关系密切.结论 卢龙猪GARV LLP48可能是猪的VP4与人的VP7、VP6、NSP2和NSP4自然重组.
