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TPI基因文献资料
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基于TPI基因的城市污水中蓝氏贾第鞭毛虫的分子鉴定
目的 对哈尔滨市污水处理厂原水中的蓝氏贾第鞭毛虫进行分子鉴定.方法 收集哈尔滨市污水处理厂原水样,提取基因组DNA,巢式PCR扩增蓝氏贾第鞭毛虫TPI基因,通过序列分析确定蓝氏贾第鞭毛虫的集聚体类型和亚型,并进行同源性分析.结果 从哈尔滨市污水处理厂原水DNA提取物中扩增出蓝氏贾第鞭毛虫TPI基因,经分子鉴定为蓝氏贾第鞭毛虫集聚体AⅡ,其序列与文献报道人源蓝氏贾第鞭毛虫集聚体AII序列(AB516351,FJ560570,EF688021)的同源性为100％.结论 哈尔滨市污水处理厂原水中存在蓝氏贾第鞭毛虫集聚体AII,威胁当地居民健康.
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腹泻患者艰难梭菌的检测及分析
目的 了解广州地区腹泻病人中艰难梭菌(CD)及其毒素基因的分布情况并进行相关分析.方法 收集261例住院及门诊腹泻病人粪便标本并提取宏基因组DNA,用PCR方法检测CD的种特异性基因tpi和毒素基因,包括毒素A基因(tcdA)、毒素B基因(tcdB及二元毒素基因,并对检测患者的临床资料与CD携带的关联性进行分析.结果 261例腹泻病人粪便标本中,tpi基因阳性的有14例(5.4％),毒素阳性的6例(2.3％),均为A、B毒素同时阳性,未发现产二元毒素菌株.在14例tpi阳性标本中,71.4％ (10/14)为住院病人,28.6％ (4/14)为门诊病人;57.1％ (8/14)为大于60岁患者,35.7％ (5/14)为儿童.基因序列分析发现tpi基因有2种基因型,tcdA有2个基因型,tcdB有4个基因型,未发现明显优势基因型.结论 目前在广州,CD的感染为散发;不能忽视儿童及社区获得性CD相关性腹泻的监测.
