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BQCV文献资料
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黑蜂王台病毒中国BQCV-JL1株的分离鉴定及全基因组序列分析
收集吉林蜂场的蜜蜂蜂蛹病料的RNA作为扩增模板,依据GenBank公布的黑蜂王台病毒(Black queen cell virus,BQCV)的全基因组序列,自行设计了10对引物,运用RT-PCR首次获得中国BQCV毒株的全基因组序列,命名为中国BQCV-JL1株.其全基因组序列由8 358个碱基组成,与GenBank公布的其他6株BQCV毒株的全基因组序列相比,同源性为86％～93％.中国BQCV-JL1株ORF 1的位置为546 nt～4 676 nt(4 131 nt),ORF 2位于5 750 nt～8 203 nt,两个ORFs之间存在一段长为543 nt(4 891 nt～5 433 nt)的ORF3.中国BQCV-JL1株第一个基因功能区ORF1'的位置为546 nt～5 429 nt,包含ORF 1和ORF 3.在ORF2之前存在内部核糖体进入位点(IRES),其末尾3碱基为CCU(5 642 nt～5 644 nt),为促进ORF 2翻译的起始密码子,中国BQCV-JL1株第二个基因功能区ORF2'的位置为5 642 nt～8 203 nt.中国BQCV-JL1株与Hungary 10(EF517515)同源性高(93％),且分析核苷酸序列和氨基酸序列,与South Korea(JX149531)株接近,表明中国BQCV-JL1株与South Korea(JX149531)株均有可能来自欧洲.中国BQCV-JL1株与其他6株全基因组序列在ORF位置划分上存在差异,其原因是部分位置发生基因突变.
