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微生态学变性梯度凝胶电泳方法文献资料
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慢性胃炎患者腻苔的口腔微生物指纹图谱分析
目的 研究慢性胃炎腻苔患者的口腔微生物菌群组成特征,探索腻苔的形成机制.方法 收集40例慢性胃炎患者舌苔样本(腻苔组20例,非腻苔组20例)和20名正常人舌苔样本(健康对照组).利用16S rRNA基因变性梯度凝胶电泳(denatured gradient gel electrophoresis,DGGE)技术检测各组舌苔微生物菌群,得到舌苔样本细菌DGGE图谱,将其数字化后进行主成分分析(PCA)和偏小二乘判别法分析(PLSDA).结果 慢性胃炎腻苔组、非腻苔组与健康对照组舌苔的微生物组成存在差异.(1)腻苔组与非腻苔组之间有5条具有显著差异的条带,PLS判别模型的预报准确率达到97.5％；腻苔组和健康对照组之间有8条具有显著差异的条带,PLS判别模型的预报准确率达到95.0％；非腻苔组和健康对照组之间的条带差异不明显.(2)腻苔组的8号条带亮度高于非腻苔组和健康对照组,测序结果显示其近邻居为Moraxella catarrhalis(黏膜炎莫拉氏菌/卡他莫拉菌),但两者相似度仅为96.2％,可能是目前尚未报道的一个新菌种；10号条带亮度为健康对照组＞非腻苔组＞腻苔组,测序结果显示其与Rothia mucilaginosa(黏滑罗斯菌)相似度达到100.0％.结论 8号条带的菌种可能与慢性胃炎腻苔的形成有密切关系,10号条带的菌种可能与慢性胃炎非腻苔形成有一定的关系,提示口腔微生物菌群的变化可能是腻苔的形成机制之一.
关键词： 慢性胃炎 舌诊 腻苔 微生态学变性梯度凝胶电泳方法
