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甲型病毒性肝炎病毒文献资料
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一起甲型病毒性肝炎暴发疫情的病原学诊断与基因分析
目的 查明引起2004年宁波局部地区甲型病毒性肝炎(甲肝)暴发疫情的病原并分析其基因特征.方法 用酶联免疫吸附试验检测血清中的甲肝病毒IgM抗体(HAV IgM)和戊型肝炎病毒IgM抗体(HEV IgM),利用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)检测粪便样品中的HAV核酸(RNA)并扩增VP1基因,测序结果利用DNA star软件进行比对分析.结果 172份血清样品中HAV IgM均为阳性,HEV IgM均为阴性.172份粪便样品中共检测到HAV RNA阳性样品74份,占43.0%.选择5份样品进行HAV VP1基因扩增并测序,测序结果经过比对后发现4株宁波株(NB2004-10、NB2004-11、NB20IM-51和NB2004-71)的VP1基因是完全一致的;NB2004-75与以上4株的核苷酸的同源性为99.9%,氨基酸的同源性为99.7%;宁波株与HAV各基因型标准株比较,与IA亚型毒株AH2的核苷酸和氨基酸的同源性高,分别为98.9%和99.7%～100.0%;与中国其他地区流行株比较,核苷酸和氨基酸的同源性波动于89.4%～96.7%和97.0%～100.O%.结论 引起这次肝炎暴发疫情的病原是甲肝病毒,其基因型为LA亚型,与日本株AH2、AH3亲缘关系近,与中国其他地区流行株处于不同的进化簇上.
