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HCR2全长cDNA文献资料
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高凝状态大鼠主动脉表达上调新基因HCR2的克隆及生物信息学分析
目的获得高凝状态大鼠主动脉上调表达新基因HCR2的全长cDNA,并对该基因进行生物信息学分析.方法从高凝大鼠主动脉中表达显著上调的序列标签(EST,GenBank登录号为BQ901227)出发,利用cDNA末端快速扩增(rapid amplification of cDNA end, RACE)和巢式PCR技术扩增其全长cDNA,利用NCBI的数据库对其进行生物信息学分析.结果成功地获得了HCR2的全长cDNA,在GenBank中的登录号为AY234417.用RT-PCR证实HCR2是高凝大鼠表达上调基因.生物信息学分析显示,该基因cDNA序列全长为1275 bp,定位于大鼠染色体4q11,编码由78个氨基酸组成、相对分子质量为8841.7、pI为8.59的蛋白质;无信号肽序列和跨膜序列,很可能是一种核蛋白;与已知蛋白无明显同源性.结论 HCR2 的成功克隆为进一步研究其生物学功能及其在高血凝的发生、发展中的作用奠定了坚实基础.