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大肠埃希菌和志贺菌mazEF基因搜索及蛋白分子进化分析
目的 对已完成基因组测序的10株大肠埃希菌、6株志贺氏菌和1株未定名肠杆菌进行MazE和MazF蛋白的分子进化分析.方法 用BioCyc提供的Pathway Tools(13.5版)搜索已完成基因组测序的10株大肠埃希菌、6株志贺菌和1株未定名肠杆菌毒素MazF编码基因mazF(别名chpA)和抗毒素MazE编码基因mazE(别名chpR),再用MEGA4.1软件中的Minimum Evolution法对MazE和MazF蛋白做分子进化分析.结果 共有12株搜索到毒素MazF(编码基因为mazF),11株搜索到抗毒素MazE(编码基因为mazE),另有5株没有搜索到MazEF编码基因.分子进化分析提示大肠埃希菌和志贺菌的mazE和mazF的保守性较好.结论 MazEF是在原核染色体发现的第一个毒素-抗毒素(TA)系统,但不是每株大肠埃希菌和志贺菌均存在这个系统,有可能存在其他TA系统.MazEF缺失株表现为对抗菌约物抵抗,又因MazEF介导细菌的细胞程序性死亡,mazEF有可能成为抗菌药物的新靶位.
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mazEF基因在肠球菌中的分布及与耐药的相关性研究
目的 研究mazEF基因在肠球菌临床分离株的分布特征,并探讨其与肠球菌耐药的相关性.方法 收集包头地区2013年1月-2016年12月临床来源的肠球菌187株,随机选出90株作为实验菌株,采用聚合酶链反应(PCR)法及基因测序技术检测mazEF基因,VITEK-2 Compact全自动微生物鉴定及药敏系统鉴定肠球菌并同步测定10种抗菌药物(氨苄西林、青霉素、四环素、替加环素、左氧氟沙星、环丙沙星、万古霉素、利奈唑胺、高水平庆大霉素和红霉素)低抑菌浓度(minimal inhibititory concentration,MIC),分析mazEF基因在肠球菌基因组中的分布及与耐药之间的关联.结果 90株肠球菌属,mazEF基因在肠球菌属基因组的阳性率为86.7％.在对氨苄西林、左氧氟沙星、青霉素、四环素、高水平庆大霉素、红霉素、环丙沙星和万古霉素耐药的肠球菌中,mazEF基因阳性率分别为88.7％、86.2％、89.1％、84.6％、81.5％、85.0％、89.4％和60.0％,敏感的肠球菌中,mazEF基因阳性率分别83.7％、87.5％、82.6％、92.0％、94.4％、100.0％、87.1％和88.2％,耐药株和敏感株中,mazEF基因阳性率无统计学差异(P＞0.01).结论 mazEF基因在肠球菌基因组中分布的阳性率为86.7％(78/90),其分布与对氨苄西林、左氧氟沙星、青霉素、四环素、高水平庆大霉素、红霉素和环丙沙星耐药无显著相关性,与天然耐万古霉素也无显著相关性.
