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环介导等温核酸扩增法检测尖锐湿疣患者疣体组织中低危型人乳头瘤病毒分型的评价及分析
目的 评价并分析环介导等温核酸扩增法(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)检测尖锐湿疣患者(Condyloma acuminatum,CA)疣体组织中低危型人乳头瘤病毒(human papillomavirus,HPV)的分型情况.方法 针对CA常见HPV的7种亚型(包括HPV6、11、16、18、42、43、44型)基因的保守序列L1,设计LAMP引物.收集40份上海市皮肤病医院2015年6月至2016年6月病理确诊为CA患者的疣体组织石蜡包埋块,提取DNA,以其为模板进行LAMP,分别使用羟基萘酚蓝(hydroxynaphthol blue,HNB)颜色指示剂和琼脂糖核酸电泳同时判定扩增结果,并与PCR流式荧光杂交法的检测结果进行比较.结果 40份样本中共测得HPV阳性30份,其中HPV6型18份,11型7份、16型1份,42型1份,43型2份,44型2份,有1份为43及44型混合阳性,未测得18型阳性样本.LAMP法与PCR流式荧光杂交法总体符合率为95%(38/40).结论 LAMP法可用于常见HPV低危型别的检测,且操作简便、准确.
关键词: 环介导等温核酸扩增法 尖锐湿疣 人乳头瘤病毒 -
环介导等温核酸扩增法在基因检测中的应用
环介导等温核酸扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)是一种操作简单、快速、灵敏度高,而且特异性强的DNA扩增技术,已广泛应用于临床诊断,胚胎性别鉴定,以及细菌和病毒等病原微生物的检测.本文简述了环介导等温核酸扩增技术的原理、特点和在基因检测中的应用,分析了该技术存在的问题,并对该技术未来的发展进行了展望.
关键词: 环介导等温核酸扩增法 基因检测 应用 -
环介导等温核酸扩增法快速检测副溶血性弧菌的研究
目的 基于环介导等温核酸扩增法(LAMP)建立副溶血性弧菌tlh基因的快速检测方法.方法 以副溶血性弧菌tlh基因为扩增的靶序列分别设计外引物、内引物和环引物各1对,通过引物特异性识别tlh基因上的6个独立区域在恒温条件下扩增靶序列,快速检测副溶血性弧菌.并对该法进行灵敏度、特异度试验,将该方法与荧光定量PCR法检出率进行统计学比较.结果 LAMP法低检出限为10· fg/μl,灵敏度是荧光定量PCR的10倍;特异度实验中除检出2株副溶血性弧菌外,6株非副溶血性弧菌均未检出;LAMP法与荧光定量PCR法检出率差异无统计学意义(P>0.05).结论 LAMP法具有高特异性、高效性、快速简便易检测等特点,适合现场快速检测,在食物中毒暴发处置中有深远的经济价值.
关键词: 副溶血性弧菌 tlh基因 环介导等温核酸扩增法