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S-腺苷酸脱羧酶文献资料
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铁皮石斛S-腺苷酸脱羧酶基因DoSAMDC1的克隆及特征分析
S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶(S-adenosyl-L-methionine decarboxylase,SAMDC)是多胺合成的关键酶,通过调节多胺的代谢途径参与植物的多项生理生化过程.本文利用cDNA末端快速克隆技术(RACE),首次从铁皮石斛共生萌发种子中分离得到一个新的SAMDC基因,命名为DoSAMDC1 (GenBank注册号JX966243),并对其编码蛋白的理化性质、保守结构域等特征进行分析.生物信息学分析表明,DoSAMDC1基因的全长为1 979 bp,涵盖tiny-uORF、small-uORF和mainORF 3个植物SAMDC基因特征ORF.mORF编码一条368个氨基酸的肽链,预测分子质量为40.7 kD,等电点为5.2,编码蛋白不含信号肽,具有22个氨基酸的跨膜域(89～110位),具有植物SAMDC的典型结构特点,包括酶原剪切位点、PEST结构域及催化功能必须的氨基酸.序列比对及系统发育树分析结果表明DoSAMDC1与单子叶植物SAMDC具有很高的同源性,与双子叶植物的亲缘关系较远.应用实时荧光定量PCR对DoSAMDC1基因在石斛不同组织中的表达模式分析发现,该基因在未接菌的植物组织中表达变化差异不大,在接菌共生萌发的植物种子中显著上调表达,为未萌发种子的2.74倍,具有受真菌侵染诱导表达的特性,揭示其可能通过参与多胺调控途径在植物-真菌共生方面发挥作用.
