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vpu蛋白文献资料
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江苏省1例HIV长期无进展者体内病毒的序列特征和溯源分析
目的 分析感染艾滋病病毒1型(HIV-1)后长期无进展者体内病毒的序列特征,探讨影响艾滋病疾病进程的病毒学因素.方法 HIV-1病毒载量用HIV-1 Monitor Version 1.5版本试剂在AmplicorCobas上检测;CD4+T淋巴细胞计数用multitest四色试剂在FASCalibur上进行计数;HIV-1近全长序列用三对引物扩增后进行测序,用ContigExpress软件进行序列编辑和拼接;HIV-1亚型用在线的REGA HIV-1 Subtyping Tool-Version 3.0软件分析;HIV-1的溯源用BEAST软件包,采用贝叶斯马尔可夫链-蒙特卡罗(MCMC)算法构建系统进化树,推断该HIV-1毒株在中国初的流行时间和地区;将HIV-1各蛋白的序列提交到至SWISS-MODEL蛋白质同源建模数据库(http://swissmodel.expasy.org/interactive),构建蛋白质结构.结果 该感染者在潜伏期体内的病毒载量处于较低水平(4.32×103拷贝/mL),外周血中CD4+T淋巴细胞在感染10年后仍然高于500个/μL,该感染者感染的病毒为B亚型,初于1992年左右在我国河南省流行.该病毒编码的Vpu与参考株HBX2编码的Vpu蛋白相比,结构存在显著的差异,这种差异可能影响该蛋白的功能.结论 该感染者为长期无进展者,Vpu蛋白功能的部分丧失可能与疾病的长期无进展有关.
