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CardioVISTA:进化保守转录元件的可视化在线程序
目的 心脏发育研究领域中的转录调控一直是热点研究问题,它影响了发育过程的各个环节.为了进一步利用多物种的基因组,定位进化保守的转录因子调控位点,我们利用CardioSignal数据库的数据分析VISTA数据库多重比对后的基因组序列.方法 在本文中,我们采用Perl语言和后台MariaDB数据库,可视化的展示基因组序列中的保守调控元件.结果 我们的程序能够分析VISTA格式的多重比对数据,能够动态展示基因组保守元件在整个DNA序列的位置.结论 我们的CardioVISTA程序是今后转录调控研究中的利器.
