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  • 5种血浆游离DNA提取方法的比较

    作者:杨麒巍;杜珍武;赵冠杰;于杉;张琳;李秀英;白金萍;刘颖男;张桂珍

    目的 分别应用5种方法进行血浆游离DNA的提取,从而判定与筛选佳的血浆cfDNA提取方法.方法 采集19例健康人血浆标本,针对每一样本取350μl血浆分别应用经1次/2次酚-氯仿-异戊醇抽提法,经1次/2次酚-氯仿-异戊醇抽提配合微量DNA助沉剂法和介孔纳米磁珠法5种方法进行cfDNA提取,应用紫外分光法测定提取cfDNA的含量与纯度,应用实时荧光定量PCR方法以提取血浆cfDNA为模板进行扩增反应,以验证提取效果.结果 应用5种方法从19例350μ1血浆样本中提取的血浆cfDNA含量分别为(6971.43±1934.40) ng/ml、(2196.86±823.94) ng/ml、(12397.14±4197.37)ng/ml、(5568.29±1618.17) ng/ml和(7458.57±3706.83)ng/ml,A260/A280值分别为0.93±0.07、1.09±0.12、1.15 ±0.05、1.16±0.12和0.89±0.19,RT-qPCR扩增成功率为100%.结论 经1次酚-氯仿-异戊醇配合微量DNA助沉剂法提取量大,纯度高,所提取的血浆cfDNA可以为RT-qPCR提供模板,进行后续实验.

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