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血清蛋白指纹技术在冠心病不稳定型心绞痛诊断中的应用
目的 采用蛋白质组学新技术筛选冠心病不稳定型心绞痛(unstable angina,UA)患者血清蛋白标志分子,建立诊断不稳定心绞痛的蛋白分类模型.方法 冠心病不稳定型心绞痛患者48例,男28例,女20例;正常健康人60例,患者出现症状24 h内采血,分离血清.样本分为两组:第一组为训练组,包括UA患者和正常健康人各30例,性别年龄相当;第二组为盲法分析组,包括剩余18例UA患者和26例正常健康人.利用(surface enhanced laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)技术对血清样本进行蛋白质谱分析.采用蛋白飞行质谱仪(PBSII-C型)对结合在WCX2芯片上的血清蛋白进行读取分析.采用Ciphergen Proteinchip 3.1软件分析分组数据及相关性,Biomarker Wizard软件对不同组相同质荷比的蛋白含量进行t检验,P＜0.01时具有统计学意义,用Biomarker Patterns System建立分类树模型.结果 UA患者与正常人血清蛋白组比较后发现了25个表达差异蛋白,其中13个蛋白在UA患者血清中高表达,12个低表达.软件分析系统利用上述蛋白建立了一个分类模式,在训练组中敏感性和特异性均为96.6%.盲法分析显示其对UA患者的诊断敏感性为94.4%,特异性为100%,阳性预测值为100%,阴性预测值96.3%.结论 SELDI技术能够有效快速地从血清中筛选出UA患者相关的标志蛋白分子,利用蛋白模式分类方法对冠心病患者进行风险评估和冠心病的筛查是一个比较好的方法.
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创伤脓毒症患者血清小分子蛋白组变化研究
目的 观察创伤脓毒症患者血清小分子蛋白组学特征,并观察患者血清小分子蛋白质组随脓毒症进程的变化规律.方法 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF-MS)技术对血清样本进行蛋白质谱分析,比较24例见刊人、24例创伤患者、12例创伤后脓毒症患者的血清小分子蛋白水平差异,经聚类分析,揭示创伤脓毒症患者的蛋白组学特性.通过对创伤脓毒症患者发病过程中血清小分子蛋白水平的连续观察,通过聚类分析,揭示创伤脓毒症发病进程的组学特征.结果 创伤脓毒症患者血清小分子蛋白谱与创伤对照组和健康对照组比较,均存在明显差异,发现了28个差异蛋白分子,处在不同创伤脓毒症发展阶段的患者的血清小分子蛋白谱之间也存在着明显差别.结论 血清小分子蛋白谱的波动可以较早诊断创伤脓毒症,并可通过血清小分子蛋白谱的变化观察创伤脓毒症的严重程度.
关键词： 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱 创伤脓毒症 生物标志分子 -
微小RNA作为疾病标志物的研究进展
近年来,miRNA的功能研究及其与疾病的发生发展和诊断治疗的关系备受关注.miRNA是一类长约22个核苷酸的非编码小片段RNA,通过与靶基因mRNA的3’端非翻译区相互作用,从而调控靶基因的表达,进而广泛的作用于生长发育、衰老凋亡、肿瘤发生、免疫应答等各个生物学过程[1].目前在哺乳动物中已发现上千个miRNA基因,而且其数据库仍处于不断更新中.研究发现,miRNA在肿瘤、心血管系统和免疫系统等疾病中存在表达失调,可以作为疾病诊断、病理分型、预后判断以及个体化治疗的生物标志分子.我们对miRNA作为疾病诊断标志物的研究进展综述如下.
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应用SELDI-TOF-MS技术建立直肠癌筛选血清蛋白质指纹图谱模型
目的:建立直肠癌筛选血清蛋白质指纹图谱模型并初步验证.方法:用表面加强激光解析电离飞行时间质谱技术(SELDI-TOF-MS)及WCX2蛋白芯片获得新发直肠癌、直肠息肉患者和正常人血清的蛋白质指纹图谱,用计算机软件进行比较分析,建立直肠癌的筛选模型,并对其进行了盲法验证.结果:直肠癌组与对照组共有26个蛋白质有显著性差异(P＜0.05);以其中4个蛋白质生物标志物(质/荷比9295,3 730,3 938和4 095)组建的筛选模型检测正确率为96.8%(93/96),经盲法验证,其灵敏度为95.0%(38/40),特异性为93.4%(45/48).结论:建立的血清蛋白质指纹图谱模型能够区分直肠癌与非直肠癌患者,SELDI-TOF-MS在直肠癌的诊断及肿瘤特异性蛋白质生物标志分子的筛选等方面具有一定价值.
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应用蛋白质芯片技术筛选直肠癌患者
目的 应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱技术(SELDI-TOF-MS)从直肠癌患者血清中筛选标志蛋白,找出佳的标志蛋白组合模式作为临床诊断指标.方法 采用WCX2芯片及SELDI-TOF-MS技术对98例直肠癌患者及40例对照组血清进行蛋白质指纹图谱检测分析,所得到的结果采用Biomarker Wizard和Biomarker Patterns System软件分析.结果 直肠癌组与对照组共有26个蛋白质差异有显著性(P＜0.05);以其中4个蛋白质生物标志物(质/荷比9295、3730、3938和4095)组建筛选模型,经盲法验证,其敏感度为95.0%(57/60),特异性为93.4%(45/48);CEA敏感度为68.3%(41/60),特异性为77.1%(37/48);CA199敏感度为58.3%(35/60),特异性为75%(36/48).结论 SELDI-TOF-MS技术的敏感度和特异性远远高于目前所采用的某一单独的标志物的血清学诊断,其结果对进一步研究直肠癌的蛋白质组学改变及其临床应用可能具有重要意义.
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应用SELDI技术建立喉癌患者血清蛋白质指纹图谱筛选模型
背景与目的:建立喉癌患者血清蛋白质指纹图谱筛选模型.材料与方法:用表面加强激光解析/电离飞行时间质谱技术(SELDI-TOF-MS)及WCX2蛋白芯片对33例喉癌患者、30例声带息肉患者血清样本进行分析,将获得的血清蛋白质指纹图谱,用计算机软件进行比较分析,并建立喉癌的筛选模型.结果:喉癌组与声带息肉对照组共有27个蛋白质具有显著性差异;以其中3个蛋白质生物标志物(质/荷比分别为2 779、4 626和5 663)组建的筛选模型检测灵敏度为93.9%,特异性为100%.结论:建立的血清蛋白质指纹图谱模型能够区分喉癌与声带息肉患者,SELDI技术在喉癌的诊断及肿瘤特异性蛋白质生物标志分子的筛选等方面是一种快速而有效的工具.
关键词： 喉癌 表面加强激光解析/电离蛋白质芯片 生物标志分子
