首页 > 文献资料
-
2013年山东省聊城市柯萨奇病毒 A 组16型基因特征分析
目的:分析2013年聊城市手足口病( hand foot and mouth disease, HFMD)病原构成及柯萨奇病毒A组16型(coxsackievirus A16, CVA16)VP1区基因特征。方法采集聊城市2013年1—12月监测点医院手足口病患儿的粪便和咽拭子标本,采用RT-PCR方法对HFMD疑似病例标本进行病原鉴定,选取CVA16核酸阳性标本,使用RD细胞和Vero细胞进行病毒分离。对9株CVA16病毒阳性的分离物进行VP1区基因扩增及核苷酸序列测定,与其他各基因型及亚型的代表株序列构建亲缘进化树,并进行核苷酸和氨基酸同源性分析。结果2013年聊城市共检测手足口病病例标本961份,阳性者747份,阳性率77.73%。其中人肠道病毒71型( enterovirus 71, EV71)74份,占阳性标本的9.91%,CVA16130份,占17.40%;其他肠道病毒543份,占72.69%。应用 BioEdit 和 MEGA 4软件分析发现,9株CVA16彼此间VP1核苷酸和氨基酸水平同源性较高,分别在97.7%~100%和99.3%~100%之间。亲缘进化树分析显示山东聊城CVA16分离株与B2b基因亚型的代表株处于同一分支,属于B2b基因亚型。结论2013年引起聊城市手足口病的主要病原体以其他肠道病毒为主,兼有CVA16和EV71参与,而CVA16属于B2b亚型。手足口病的病原谱正发生改变,应加强EV71、CVA16及其他肠道病毒的分子流行病学监测,了解其基因特征,对预防和控制手足口病具有重要意义。
关键词: 柯萨奇病毒A组16型 基因特征 手足口病 B2 b亚型