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人巨细胞病毒临床株UL133基因序列遗传变异分析
目的 研究人巨细胞病毒(HCMV)临床感染株的UL133基因序列特征. 方法 采集HCMV-DNA阳性者的临床标本,PCR扩增UL133基因全序列,阳性扩增产物克隆到pEASYTM载体后进行序列测定,结合来自于NCBI数据库的15条序列进行UL133基因多态性分析. 结果 获得20例HCMV感染者的UL133全长序列.多态性分析显示HCMV临床株UL133基因核苷酸变异率为0~9.7%,氨基酸变异率为0~40.2%;不同感染者UL133序列5′端的第32-45位发生了相对集中的非同义突变,其他部分序列较少出现氨基酸缺失及错义突变.其中1例临床感染者UL133序列在163-166位核苷酸出现移码突变.综合NCBI数据库的15株序列分析显示,UL133序列分为G1、G2、G3、G4、G5、G6等6个型,但未发现基因型与HCMV感染的临床表现具有显著关联性.编码蛋白翻译后修饰位点包括酪蛋白激酶磷酸化位点(CKP),蛋白激酶C位点(PKC)以及NLS_BP核定位信号(NLS_BP).与Toledo株相比,有1株发生移码突变,其他临床株UL133基因编码产物翻译后修饰位点相对保守. 结论 HCMV UL133基因核苷酸序列及其编码的氨基酸序列高度保守,但仍具有一定的多态性.这种多态性与HCMV感染临床症状的关系尚待进一步研究.