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  • 一株神经外低毒力乙型脑炎病毒株的全基因序列分析

    作者:刘欣玉;俞永新;王环宇;梁国栋;贾丽丽;董关木

    目的 探究1株新分离的基因Ⅰ型乙脑病毒株的分子生物学特征及其低毒力的分子基础. 方法 对病毒株扩增,提取其RNA,逆转录PCR后测序,序列与来自世界不同地区不同基因型的野毒株进行同源性比较,并与强毒P3株进行氨基酸位点比对. 结果 SC04-17在核苷酸和氨基酸序列上,存在与其他基因型毒株不同的特点,与世界各地毒株核苷酸差异率为1.8%~16.5%,氨基酸差异率为0.8%~5.0%;与减毒活疫苗株SA14-14-2的核苷酸、氨基酸同源性分别为88.5%和97.6%,与灭活疫苗株P3核苷酸、氨基酸同源性分别为88.8%和97.9%;与P3强毒株比对,发现72个氨基酸位点差异,分布在全基因的各个区域(E、NS5、NS1和NS3区).结论 SC04-17株的基因序列存在一些独特位点,这些位点的氨基酸变化可能与其低毒力特征有关.

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