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中国2006年麻疹野病毒血溶素基因特征分析
目的 研究中国2006年流行的麻疹野病毒代表株血溶素蛋白(Fusion Protein,F)基因的分子特征,与其他年份毒株相比分析F基因的变异规律.方法 从2006年各省(自治区、直辖市)送检的麻疹野病毒中选取9株代表株,使用逆转录-聚合酶链反应扩增病毒的F基因伞长,并进行核苷酸序列测定,同时与中国疫苗株及其他年份毒株进行序列比对及基因亲缘性关系分析.结果 2006年9株中国流行麻疹野病毒代表株,其核苷酸同源性为98.5%～99.8%,氨基酸同源性为99%～100%;与中国疫苗株沪191相比,其核苷酸同源性为95.4%～96.2%,氨基酸同源性为96.7%～97.2%;与1999～2003年代表株相比,其核苷酸同源性为97.9%～99.7%,氨基酸同源性为98.1%～100%.F基因3个糖基化位点(第32、64、70位氨基酸)、对病毒整合功能起着重要作用的第112位精氨酸(Arg)、第195位亮氨酸(Leu)未发生改变.结论 中国2006年流行的麻疹病毒F基因变异不大,与其他年份毒株相比变异也不明显.F蛋白的重要功能位点未发生变异,F蛋白的变异与2006年麻疹流行无相关性.但由于F蛋白对病毒感染细胞和促使机体产生抗体具有重要意义,对F蛋白变异规律进行常规监测,对了解麻疹病毒变异规律和评价疫苗的保护效果具有重要意义.
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13株中国麻疹野病毒血溶素蛋白基因特征分析
目的 分析1999～2003年中国(未包括香港、澳门特别行政区和台湾地区,下同)流行的H1基因型麻疹野病毒代表株血溶素蛋白(Fusion Protein,F)基因的分子特征.方法 从1999～2003年中国分离的麻疹野病毒株中,选取13株H1基因型代表株,包括H1a基因亚型麻疹野病毒8株和H1b基因亚型麻疹野病毒5株.使用逆转录-聚合酶链反应扩增病毒的F基因全长,并进行核苷酸序列测定,同时与中国疫苗株及其它国家的A、D3、D6、D7、E基因型参考株进行序列比对及基因亲缘性关系分析.结果 1999～2003年13株中国流行麻疹野病毒代表株中,核苷酸同源性为98.1%～99.0 %.氨基酸同源性为98.1%～100.0%,与中国疫苗株沪191相比,其核苷酸同源性为95.7%～96.2%,氨基酸同源性为96.9%～97.2%;而与其它基因型相比,核苷酸同源性为94.4%～96.2%.F基因3个糖基化位点(第32、64、70位氨基酸)、对病毒融合功能起着重要作用的第112位精氨酸、第195位亮氨酸未发生改变.结论 1999～2003年中国流行的H1基因型麻疹野病毒的F基因无明显差异,F蛋白上已知的重要功能位点未发生变异,推测中国流行的麻疹野病毒F蛋白的结构和功能未发生较大改变,但由于F蛋白是重要的功能蛋白,对F蛋白核苷酸和氨基酸的变异规律进行常规监测,对了解麻疹野病毒流行特点及其遗传变异规律具有重要意义.
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宁波地区2004年-2009年麻疹病毒分离株血溶素蛋白基因特征分析
目的:分析宁波地区2004年-2009年流行的麻疹病毒分离株血溶素蛋白(Fusion protein,F)基因的序列特征.方法:采用RT-PCR扩增宁波地区2004年-2009年分离到的21株麻疹病毒株的F基因并进行序列测定,与疫苗株沪191、changchun-47、Edmonston株及国内核苷酸同源性高的毒株zhejiang05-04、IMB-1比较并分析毒株变异情况.结果:2004年-2009年宁波地区流行的21株麻疹病毒株中,核苷酸同源性为95.2%-100.0%,氨基酸同源性为98.0%-99.8%;与中国疫苗株沪191相比,其核苷酸同源性为95.2%～96.1%,氨基酸同源性为96.4%～97.3%.F基因3个糖基化位点(第32、64、70位从),对病毒融合功能起重要作用的第112位、第121位、第195位、第549位氨基酸均未发生改变.结论:2004年-2009年宁波地区流行的麻疹病毒株F基因关键位点未发生变异,本研究对了解本地区麻疹病毒遗传变异规律及疫苗的选择具有重要意义.
