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G9基因型文献资料
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2009～2010年北京儿童腹泻中轮状病毒新VP4基因亚型的研究
P[8]b基因亚型是国内外新近发现的A组人轮状病毒(HRV) VP4基因的一种新亚型,本研究旨在建立有效鉴别HRV P[8]a和P[8]b基因亚型及P[4]和P[6]基因型的VP4基因打点杂交分型方法,并运用此方法对2009～2010年首都儿科研究所附属儿童医院门诊及住院腹泻患儿中P[8]b基因亚型HRV的流行情况及其G/P基因组合情况进行研究.通过对GenBank序列数据库可检索到的国内外HRV各种P基因型及亚型的VP4基因序列应用相关软件进行基因分析,在不同基因型别间核苷酸变异密集而相同P基因型内核苷酸高度保守的的位置设计各型别探针,并分别以本实验室上传GenBank的北京HRV地方株P[4]和P[6]基因型及P[8]a和P[8]b亚型的VP4基因作为相应型别探针的合成引物的设计模板及探针经PCR合成的合成模板,合成地高辛素标记的DNA探针.经测序验证所建立的VP4基因杂交分型方法结果可靠.对门诊88例(55％,88/160)及住院79例(70.5％,79/112) HRV腹泻患儿的P分型结果显示P[8]a亚型仍为主要型别,前者为96.6％ (85/88),而后者为62.0％(49/79);P[8]b亚型在住院HRV感染腹泻患儿中占较高比例(27.9％,22/79),虽然其在门诊HRV感染患儿中也存在,但仅占2.3％(2/88);另外单纯P[4]基因型HRV感染仅在住院腹泻患儿中检测到1例(1.3％,1/79),而P[6]基因型在门诊及住院HRV感染腹泻患儿中均未检测到；本组标本中HRV P[8]b亚型主要与G9基因型组合.本研究表明G9P[8]b型HRV在北京腹泻儿童中有流行.
