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中药南五味子及其混淆品绿叶五味子果实的ITS序列分析
目的: 比较研究不同产地南五味子的基源植物华中五味子及混淆品绿叶五味子的rDNA ITS碱基序列的差异及其规律,寻找南五味子和绿叶五味子果实之间的分子鉴别方法.方法: PCR直接测序,PAUP 4.0 b10软件进行对位排列分析,采用邻接法 ( neighbor-joining method) 构建邻接( NJ )系统树.结果: 华中五味子ITS长度范围为691～692 bp,ITS1和ITS2分别为282 bp和246～247 bp;绿叶五味子ITS长度范围为694～695 bp,ITS1和ITS2分别为285～286 bp和246～247 bp.不同产地华中五味子与绿叶五味子在ITS1有3个稳定的信息位点.NJ树中,产于鸡公山3个居群的绿叶五味子和天目山的1个居群及引用的2条绿叶五味子ITS序列聚为一支,bootstrap支持率为68%.结论: rDNA ITS序列可作为中药南五味子与混淆品绿叶五味子的一种良好的分子标记.
关键词： 华中五味子 绿叶五味子 rDNA内转录间隔区 -
中国不同地区蛇床的rDNA ITS序列分析
目的:探讨不同分布区的蛇床Cnidium monnieri的ITS序列变异与其地理分布和化学成分的相关性.方法:设计2对引物,Pf+Pb及P5.8S ITS1+P5.8S ITS2,PCR扩增产物纯化后用银染法或ABI 310测序.结果:得到核糖体DNA中的ITS及5.8S rDNA完全序列,18S和26S rDNA部分序列,共约700 bp.5个地点样品的ITS-1及ITS-2的序列大小分别为210～217 bp和219～224 bp.ITS-1碱基序列的遗传距离0.00～1.93%,ITS-2碱基序列的遗传距离0.46～2.34%,ITS-1较为保守.以NJ法根据ITS-2序列数据重建系统发生树.哈尔滨样品聚为一组,衡水与德州样品和郑州与高淳样品各自聚为一组.结论:ITS-2序列的变异与中国产蛇床的纬度分布相关,而其与蛇床化学型的关系尚需作进一步研究.
关键词： 蛇床 rDNA内转录间隔区 纬度 -
大连、沈阳两地须癣毛癣菌复合体的分子鉴定及DNA分型
目的 探讨大连和沈阳两地须癣毛癣菌复合体的主要组成菌种及主要组成菌种肉芽肿株和体癣株DNA分型有无差异.方法 选取大连和沈阳地区已行表型鉴定的须癣毛癣菌16株(12株体癣株,4株肉芽肿株),通过PCR扩增核糖体DNA(rDNA)的内转录间隔区(ITS),测序后利用数据库进行序列比对,对须癣毛癣菌复合体进行鉴定；PCR扩增rDNA非转录间隔区(NTS)的3个串联重复亚单位S0,S1和S2区,进行种内分型,比较菌株间型别的差异性.结果 大连、沈阳两地的16株须癣毛癣菌中,2株鉴定为断发毛癣菌,1株鉴定为苯海姆节皮菌,13株鉴定为万博节皮菌；3对不同引物扩增13株万博节皮菌NTS区,共产生8种特征性带型；万博节皮菌的体癣株和肉芽肿株的带型除S2区外,在S0,S1区及总区间均有差异.结论 大连、沈阳两地须癣毛癣菌复合体的主要组成菌种为万博节皮菌；万博节皮菌肉芽肿株和体癣株NTS区的带型有差异.
关键词： 须癣毛癣菌复合体 肉芽肿株 体癣株 rDNA内转录间隔区 rDNA非转录间隔区
