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高通量16S rDNA测序文献资料
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冠心病患者舌苔菌群结构特点及不同舌苔的菌群结构研究
目的:检测冠心病患者的舌苔微生物组16S rRNA,了解冠心病舌苔菌群结构,探讨冠心病不同类型舌苔菌群结构的差异.方法:收集冠心病患者共70例,其中薄白苔15例,黄厚苔33例,很黄厚苔22例,及健康对照组28例.采用16S rDNA测序方法分析对象的舌苔菌群结构.利用R语言软件进行treeplot构建,分析菌群差异.结果:共得到10506个不同的OTU (operational taxonomic units),样本间有显著差异的OTU有1068个(P＜0.05).将OTU与已知物种的16S数据库比对并物种注释,在门水平有16个物种,纲水平有31个物种,目水平有51个物种,科水平有86个物种,属水平有84个物种.两组样品菌群聚类为4大类,每个group均有其优势菌,group1以链球菌属(Streptococcus)为主,group2以普雷沃氏菌属(Prevotella)为主,group3以梭杆菌属(Fusobacterium)为主,group4以奈瑟菌属(Neisseria)为主.以group1为参照,group2、3、4患冠心病的风险递增(OR值分别为3.00、3.75、4.64),与患薄白、黄厚、很黄厚舌苔递增相关(generalized odds分别为0.29、0.19、0.18).冗余分析(RDA)提示group3与高敏C反应蛋白(hs-CRP)、白细胞介素6(IL-6)、白细胞介素8(IL-8)等炎症指标较其他类型具有较显著的相关性.结论:舌苔菌群结构与患冠心病风险可能相关,并影响着舌苔变化.
关键词： 冠心痛 舌苔菌群 高通量16S rDNA测序
