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CYP2C19基因多态性检测方法的建立
目的:建立检测CYP2C19基因多态性的PCR-荧光探针法,为预测CYP2C19代谢药物的疗效提供新的检测试剂盒.方法:应用Primer Express 3.0软件针对人类CYP2C19基因CYP2C19*2、CYP2C19*3和CYP2C19* 17多态性位点设计引物和探针.以经测序确认为杂合突变型、纯合突变型或野生型的人类全血基因组DNA(genomic DNA,gDNA)样本为模板,应用荧光PCR法筛选合适的引物和探针,建立和优化CYP2C19基因多态性检测荧光PCR法.然后用特定浓度且基因型已知的人类全血gDNA样本作为质控品评价该方法的准确性、灵敏度和特异性.后用100例临床样本验证该方法的临床适用性,并与直接测序结果进行比较,计算Kappa值.结果:建立的CYP2C19基因多态性检测PCR-荧光探针法,能准确地检测出CYP2C19* 2、*3和*17多态性位点杂合突变型和纯合突变型;灵敏度为每个反应体系约1 ng;以基因型已知为野生型的全血gDNA为模板进行检测的结果显示均为野生型.临床样本的检测结果显示与测序结果的一致性较好,Kappa值为1.00.结论:建立的CYP2C19基因多态性检测方法具有很好的准确性、灵敏度和特异性,且具有很好的临床适用性,可以用于CYP2C19代谢的药物疗效的预测.