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昆明种小鼠与C57BL/6J小鼠磷酸二酯酶β亚单位编码基因pde6b序列特点的比较分析
目的:分段克隆昆明种小鼠磷酸二酯酶(PDE) β亚单位编码基因pde6b CDS序列全长,分析比较昆明种小鼠与C57BL/6J小鼠PDE β亚单位编码基因pde6b序列的差异.方法:设计覆盖pde6b CDS区的引物序列,通过逆转录-聚合酶链式反应扩增并克隆入载体pMD18-T中,转化大肠杆菌,酶切鉴定后测序.通过生物信息检索、序列拼接并应用生物信息学相关软件进行序列分析.结果:克隆了野生型昆明种小鼠的pde6b CDS全长.昆明种小鼠与C57BL/6J小鼠pde6b CDS区(NM_008806)相比较存在如下不同:昆明种小鼠第706位碱基为A,而数据库中序列NM_008806为G;第1149位碱基前者为T,后者为C.昆明种小鼠与C57BL/6J小鼠pde6b编码的蛋白序列差异并不明显,仅有第236位氨基酸残基为甘氨酸(G)突变成丝氨酸(S),为相对保守性替换关系.结论:克隆了昆明种小鼠pde6b CDS 区全长序列;pde6b基因在不同种属小鼠之间编码序列存在差异,表现出多样性特点,但蛋白序列保守性较高.
