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  • 用DNAStar软件预测Rv1410c结核分枝杆菌蛋白抗原表位

    作者:李江英;白雪娟;梁艳;张俊仙;阳幼荣;赵卫国;吴雪琼

    目的 预测Rv1410c结核分枝杆菌(MTB)的抗原表位.方法 利用DNAStar软件包中Editseq软件将Rv1410c MTB氨基酸序列进行编辑保存,然后利用Protean软件进行氨基酸序列分析,预测Rv1410c MTB的二级结构、B细胞抗原表位及T细胞抗原表位,然后再用BLAST分析其与人类抗原表位的同源性.结果 Rv1410c具有丰富的二级结构,含有较多潜在的B细胞抗原肽表位,主要位于1 ~ 10、67 ~77、129 ~ 137、189 ~205、222~235、253 ~ 267、296 ~ 306、330 ~ 338、359 ~367、462~467、494~517氨基酸残基或其附近,这些区域基本上含有β转角结构,亲水性、表面可能性和柔韧性指数都较高;也含有较多潜在的T细胞表位,主要位于16 ~37、84 ~102、108 ~115、137~ 160、202 ~ 207、219 ~222、245 ~263、321 ~325、355 ~362、387 ~391、417 ~445、486 ~494氨基酸残基或其附近.结论 Rv1410c MTB既含有较多潜在的B细胞抗原表位,也含有较多潜在的T细胞抗原表位.

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