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毒力协同调节菌毛文献资料
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霍乱弧菌新类型TCP氨基酸序列生物信息学分析
目的 研究4种新类型霍乱孤茵(VC)毒力协同调节茵毛(TCP)氨基酸序列进行生物信息学特征.方法 基因序列及氨基酸序列利用DNAStar和BLASlT进行分析. 结果 对4种新类型tcpA推测的氨基酸序列的α螺旋、B折叠、疏水性、抗原表位等特征进行分析,并与国外发现的4种类型比较,N末端约100个氨基酸序列的抗原表位等特征高度一致,而C末端约60个氨基酸序列的抗原表位等特征差别较大.在对tcpA基因扩增及测序时,扩增片段包括tcDB基因5#端部分基因及其启动子区,序列分析表明,不同类型tepB的启动子区差别较大,不同类型tcpB 5#端部分基因存在多个位点突变,但均未导致氨基酸变异.结论 4种新类型TCP和国外发现的4种类型的C末端抗原表位差剐较大,保护性抗原表位主要位于C末端,提示不同类型TCP抗原交又保护性较弱.
