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Oligo基因芯片分析黄芪多糖对脑缺血再灌注大鼠DND的保护作用
目的:用基因芯片分析黄芪多糖(APs)对脑缺血再灌注损伤大鼠海马组织迟发性神经元死亡(DND)相关基因表达的影响,探讨其保护作用机制.方法:以博奥公司定制的包含5 705条大鼠的Oligo基因表达谱芯片,研究脑缺血再灌注4d的大鼠海马组织基因表达谱,观察黄芪多糖对大鼠脑缺血再灌注损伤基因表达的影响.结果:脑缺血再灌注4d的大鼠海马组织共筛选出差异表达基因9条,而这9条基因全部表达下调.结论:黄芪多糖可引起9条基因下调,其中cyp21、Ifi27、S100a9、Hipk3是参与自由基、钙超载、免疫炎症反应和凋亡的基因.Slc2a13参与葡萄糖代谢,Irp94、Fgf21、Akap5、Admr的功能还不明确.黄芪多糖通过减轻免疫介导炎症反应,来保护CA1区锥体细胞的迟发性死亡.
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高密度Oligo基因芯片筛选小鼠嗅球发育相关基因的研究
目的研究小鼠嗅球发育相关基因表达谱,探讨嗅球(olfactory bulb,OB)在室管膜前下区(anterior subventricular zone,SVZa)神经干细胞的迁移及分化中的作用.方法采用16 500点的小鼠高密度Oligo基因芯片对胚胎16 d(embryonic day 16,E16)、生后1 d(postnatal day 1,P1)、7 d(P7)、21 d(P21)OB的基因表达情况进行检测,以4个时相点全脑等量混合样品作为对照.结果通过筛选基因表达谱,得到5 277条在E16、P1、P7及P21 OB中均有表达的基因,然后采用两两对比组合,得到6组数据,从中筛选出了581个差异在3倍以上的基因,分层聚类分析将其分为6大类,进一步分析了与SVZa区神经干细胞的迁移相关基因Slit2聚类同组的28个基因及与多巴胺神经元分化相关基因TH聚类同组的17个基因.结论在小鼠嗅球发育中发现了581条表达差异≥3倍的基因,进一步通过对与Slit2相关的28个基因及与TH相关的17个基因的分析有助于揭示SVZa神经干细胞迁移及向多巴胺神经元分化的作用机制.
