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RNAdraw文献资料
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计算机辅助设计抗肿瘤凋亡基因livin的反义核酸
目的:研究利用计算机辅助设计抗肿瘤细胞凋亡基因livin mRNA的反义核酸.方法:利用RNAdraw和Sfold两种软件进行livin mRNA反义核酸的二级结构预测,并转染肿瘤细胞HeLa,诱导细胞凋亡.结果:用这种方法设计出5个反义核酸,它们能够有效地抑制肿瘤细胞HeLa的生长,促进其凋亡.结论:利用这两种计算机软件设计livin mRNA反义核酸是可行的,能够有效的促进细胞凋亡.
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靶向cyclin D1的脱氧核酶对肿瘤细胞周期的影响
应用RNAdraw和Mfold生物信息学软件进行细胞周期蛋白D1(cyclin D1) mRNA的二级结构预测,设计靶向cyclin D1的10-23型脱氧核酶 (cyclin Dl-DRz),将其转染至肿瘤细胞u251和 HeLa中.逆转录-聚合酶链反应技术(RT-PCR)检测发现,cyclin Dl-DRz能明显抑制u251、HeLa细胞中cyclin D1基因的表达,并使细胞周期蛋白E1、细胞周期蛋白A1和细胞周期蛋白B1等表达下降.流式细胞仪技术分析转染前后细胞周期的变化,显示肿瘤细胞阻滞在 G0/Gl期的比例增加.本实验建立了脱氧核酶靶位点的筛选平台,并证实cyclin Dl-DRz能有效干扰肿瘤细胞在细胞周期中的进程.
