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芋螺睡眠肽结构和功能研究进展
芋螺睡眠肽是一类与众不同的芋螺毒素,一级结构有高度同源性,它含有丰富的γ-羧基谷氨酸,和其他类芋螺毒素不同的是一般不含二硫键(除了芋螺睡眠肽-R),在结合金属离子后,构像中α-螺旋结构的成分会有不同程度地增加.芋螺睡眠肽是一类非竞争性的N-甲基-D-天门冬氨酸(N-methyl-D-aspartate,NMDA)受体的选择性抑制剂,并且具有受体亚型特异性,颅内注射芋螺睡眠肽后,实验鼠会呈现一种睡眠样症状.序列及结构分析显示,正是芋螺睡眠肽序列中高度保守的氨基酸残基决定了它们的结构及功能,文中对其结构和功能的关系作了综合分析.
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基于分子动力学模拟研究pH对抗菌肽LL-37结构的影响
目的 研究溶液pH变化对抗菌肽LL-37结构的影响.方法 利用分子动力学模拟方法,采用GROMACS软件包和OPLS-AA力场,分别在中性和强碱性条件下对LL-37进行模拟,总模拟时间达1微秒,后对模拟轨迹进行分析处理.结果 LL-37在中性环境下具有部分螺旋结构存在,特别是N端部分残基,结构具有较大柔性;在强碱性环境下,螺旋含量增多,抗菌核心区域残基形成螺旋结构的几率明显增大,结构稳定性增强.结论 pH值的增大会促进LL-37螺旋结构的形成,螺旋结构的形成和与膜结合是协同的.N端残基易形成螺旋,然后是抗菌核心区域.LL-37在中性环境下的结构特征与其行使多功能的角色相一致.该研究首次分析了LL-37在中性环境下的结构特征及pH的影响,有助于认识其抗菌机制及新药设计.
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外伤性癫痫致痫灶α-螺旋结构蛋白质的FTIR-mapping研究
目的 研究外伤性癫痫致痫灶α-螺旋结构蛋白质的红外光谱改变.方法 利用傅里叶红外光谱面扫描成像技术对大鼠外伤性癫痫脑组织标本进行检测,获得α-螺旋结构的光谱数据,以及红外光谱图像.结果 致痫灶可见明显的α-螺旋结构高吸收区,高吸收区色差与吸收度与低吸收区存在明显不同.结论 外伤性癫痫致痫灶广泛存在α-螺旋结构跨膜蛋白的改变,具有α-螺旋结构的跨膜蛋白广泛参与了外伤性癫痫的发生.
