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二代高通量测序技术文献资料
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应用新一代高通量测序技术探讨含氟涂料对 患龋乳前牙菌斑微生物的影响
目的 应用新一代高通量测序技术,了解含氟涂料处理患龋乳前牙前后菌斑微生物的变化.方法 选取20名乳前牙患龋的学龄前儿童,菌斑生物膜样本采自含氟涂料处理前和处理后3天、7天和30天的乳前牙患龋牙面;抽提全基因组DNA后,用16S rRNA基因V4-V5高变区为引物扩增后,运用MiSeq测序平台测序并分析.结果 4个时间点菌斑生物膜微生物多样性Shannon指数的比较表明,涂氟后3天、后7天比涂氟前的Shannon指数更低(P=0.011;P=0.016),提示菌斑生物膜的微生物多样性降低;涂氟后30天和涂氟前的Shannon指数持平(P>0.05),提示涂氟后菌斑生物膜的微生物多样性恢复至涂氟前的状态;PCA分析也进一步表明和Shannon指数一致;4个时间点优势菌属的比较表明涂氟后3天、后7天、后30天和涂氟前优势菌属的种类和相对丰度均没有差异,说明含氟涂料对菌斑生物膜的多样性的抑制作用没有特异性.结论 含氟涂料对患龋乳前牙牙面菌斑微生物在一定时间内有明显的抑制作用,抑制作用无特异性,微生物多样性经过一段时间还能恢复至原有状态.
