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丝氨酸蛋白酶抑制因子14文献资料
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中华按蚊丝氨酸蛋白酶抑制因子14(SRPN14)基因的多态性和进化研究
目的 鉴定和定位中华按蚊丝氨酸蛋白酶抑制因子14(SRPN14)基因,分析其在不同群体中的多态性,以及进化中的选择压力. 方法 依据中华按蚊基因组测序数据,设计引物,建立扩增SRPN14基因部分片段的体系,荧光原位杂交进行染色体定位.测定采自我国12省(市)18个采集地的中华按蚊群体的SRPN14基因部分片段序列,计算其在群体内与群体间的遗传差异,以及适应性进化的选择压力. 结果 本研究获得的中华按蚊SRPN14基因部分序列长度为429 bp,与冈比亚按蚊SRPN14基因的对应位置在核苷酸和氨基酸水平的序列一致性分别为77％和88％,位于唾腺染色体的2L∶23C亚区.采自我国13个群体411个个体中,SRPN14的等位基因数目共204个,其中51个在群体间共享,占25.00％.13个群体的中华按蚊SRPN14等位基因数目范围为11(辽宁群体LN)～33(重庆群体CQ),核苷酸多态性为0.008 (LN) ～0.024(海南群体HAN).AMOVA分析结果显示,群体内变异显著大于群体间,群体内变异占总变异的95.79％,群体间差异小,遗传分化指数(FST)值为0.042.中华按蚊各群体SRPN14基因核苷酸同义替换位点数明显多于非同义替换位点数,ω均小于1. 结论 SRPN14基因在中华按蚊群体中存在一定的多态性,其进化受到负选择压力.
关键词： 中华按蚊 丝氨酸蛋白酶抑制因子14 多态性 进化
